51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2967 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2967  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  538  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.829543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29720  hypothetical protein  40.71 
 
 
243 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2497  hypothetical protein  39.38 
 
 
244 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214172  normal  0.228117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3683  hypothetical protein  40.57 
 
 
254 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2896  hypothetical protein  36.2 
 
 
231 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2939  hypothetical protein  33.48 
 
 
246 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43910  hypothetical protein  39.47 
 
 
254 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1051  hypothetical protein  36.94 
 
 
246 aa  168  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3506  hypothetical protein  38.71 
 
 
249 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.661963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4183  hypothetical protein  38.71 
 
 
249 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1671  hypothetical protein  38.71 
 
 
249 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.465572  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3754  hypothetical protein  38.71 
 
 
249 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527223  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1620  hypothetical protein  37.74 
 
 
245 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54156  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2715  hypothetical protein  31.67 
 
 
243 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172605  hitchhiker  0.0000759068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3285  hypothetical protein  32.76 
 
 
244 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000047604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0817  hypothetical protein  31.19 
 
 
244 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.875771 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0844  hypothetical protein  31.19 
 
 
244 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3123  hypothetical protein  31.19 
 
 
244 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.723349  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3776  hypothetical protein  31.19 
 
 
244 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2375  hypothetical protein  36.32 
 
 
243 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0813656  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1017  hypothetical protein  30.73 
 
 
248 aa  152  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112148  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0687  hypothetical protein  35.83 
 
 
241 aa  151  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.548428 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0912  hypothetical protein  31.65 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3459  hypothetical protein  31.65 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0903  protein of unknown function DUF599  31.65 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0877  hypothetical protein  31.65 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2253  hypothetical protein  31.22 
 
 
244 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3102  hypothetical protein  32.11 
 
 
244 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3000  hypothetical protein  32.11 
 
 
240 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2066  protein of unknown function DUF599  35.29 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1863  protein of unknown function DUF599  35.75 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0415114  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0373  hypothetical protein  33.63 
 
 
231 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.431594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2999  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3224  protein of unknown function DUF599  33.33 
 
 
237 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.65288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1890  protein of unknown function DUF599  31.98 
 
 
233 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1810  hypothetical protein  34.65 
 
 
246 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3188  protein of unknown function DUF599  32.26 
 
 
237 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1036  hypothetical protein  32.89 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2745  hypothetical protein  31.47 
 
 
257 aa  118  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451202  normal  0.356517 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2503  hypothetical protein  31.14 
 
 
240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.194881  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2884  hypothetical protein  38.96 
 
 
245 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.468654  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2613  hypothetical protein  33.01 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0754  protein of unknown function DUF599  28.63 
 
 
229 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000312427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1353  hypothetical protein  31.4 
 
 
244 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00990342  normal  0.0401411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1021  hypothetical protein  30.65 
 
 
251 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0474935  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2681  hypothetical protein  30.65 
 
 
251 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3644  hypothetical protein  29.15 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00251577  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0207  membrane protein-like protein  29.95 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1166  hypothetical protein  31.14 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.553601  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1976  protein of unknown function DUF599  25.26 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0287224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1794  protein of unknown function DUF599  25.95 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167691  normal  0.050491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>