51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0912 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0877  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0903  protein of unknown function DUF599  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3459  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0912  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0844  hypothetical protein  91.8 
 
 
244 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3776  hypothetical protein  91.8 
 
 
244 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3123  hypothetical protein  91.39 
 
 
244 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.723349  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3102  hypothetical protein  91.39 
 
 
244 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0817  hypothetical protein  91.39 
 
 
244 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.875771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2939  hypothetical protein  75.11 
 
 
246 aa  363  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1017  hypothetical protein  72.29 
 
 
248 aa  352  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3000  hypothetical protein  71.86 
 
 
240 aa  352  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3285  hypothetical protein  68.18 
 
 
244 aa  347  7e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000047604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2253  hypothetical protein  68.07 
 
 
244 aa  342  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2715  hypothetical protein  68.09 
 
 
243 aa  332  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172605  hitchhiker  0.0000759068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1620  hypothetical protein  43.98 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54156  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1051  hypothetical protein  42.86 
 
 
246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3506  hypothetical protein  43.98 
 
 
249 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.661963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3754  hypothetical protein  43.52 
 
 
249 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527223  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1671  hypothetical protein  43.52 
 
 
249 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.465572  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4183  hypothetical protein  43.52 
 
 
249 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2497  hypothetical protein  45.24 
 
 
244 aa  191  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214172  normal  0.228117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3683  hypothetical protein  43.96 
 
 
254 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43910  hypothetical protein  43.33 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29720  hypothetical protein  42.25 
 
 
243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2375  hypothetical protein  41.4 
 
 
243 aa  164  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0813656  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2967  hypothetical protein  31.65 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.829543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2896  hypothetical protein  35.91 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0687  hypothetical protein  38.01 
 
 
241 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.548428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0373  hypothetical protein  34.84 
 
 
231 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.431594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1890  protein of unknown function DUF599  33.94 
 
 
233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2999  hypothetical protein  34.56 
 
 
237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2745  hypothetical protein  35.02 
 
 
257 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451202  normal  0.356517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3224  protein of unknown function DUF599  34.1 
 
 
237 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.65288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3188  protein of unknown function DUF599  34.26 
 
 
237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1863  protein of unknown function DUF599  30.94 
 
 
254 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0415114  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2066  protein of unknown function DUF599  29.96 
 
 
254 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1810  hypothetical protein  32.87 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1036  hypothetical protein  29.91 
 
 
229 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2503  hypothetical protein  31.96 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.194881  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2681  hypothetical protein  29.81 
 
 
251 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1021  hypothetical protein  29.81 
 
 
251 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0474935  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2884  hypothetical protein  38.56 
 
 
245 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.468654  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0207  membrane protein-like protein  31.25 
 
 
250 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0754  protein of unknown function DUF599  28.25 
 
 
229 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000312427 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2613  hypothetical protein  26.86 
 
 
257 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1353  hypothetical protein  28.51 
 
 
244 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00990342  normal  0.0401411 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3644  hypothetical protein  27.96 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00251577  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1794  protein of unknown function DUF599  29.07 
 
 
230 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167691  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1976  protein of unknown function DUF599  27.71 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0287224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1166  hypothetical protein  29.41 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.553601  normal  0.0291608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>