42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1417 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1417  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2375  hypothetical protein  26.13 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1017  hypothetical protein  23.88 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1051  hypothetical protein  26.57 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4848  hypothetical protein  32.97 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29720  hypothetical protein  22.5 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2896  hypothetical protein  23.24 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3754  hypothetical protein  25.63 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4183  hypothetical protein  25.63 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1620  hypothetical protein  25.98 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54156  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4715  hypothetical protein  30.48 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2497  hypothetical protein  24.38 
 
 		 244 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214172  normal  0.228117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43910  hypothetical protein  23.62 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3683  hypothetical protein  23.62 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3506  hypothetical protein  25.37 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.661963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1671  hypothetical protein  25.13 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.465572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3102  hypothetical protein  23.16 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3459  hypothetical protein  22.63 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0903  protein of unknown function DUF599  22.63 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0877  hypothetical protein  22.63 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0912  hypothetical protein  22.63 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0817  hypothetical protein  23.68 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.875771 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3776  hypothetical protein  23.68 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0844  hypothetical protein  23.68 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3123  hypothetical protein  23.68 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.723349  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3285  hypothetical protein  24.06 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3000  hypothetical protein  22.22 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2503  hypothetical protein  26.57 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.194881  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2253  hypothetical protein  24.73 
 
 		 244 aa  51.6  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0687  hypothetical protein  25.77 
 
 		 241 aa  51.6  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.548428 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2715  hypothetical protein  25.15 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172605  hitchhiker  0.0000759068 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43727  predicted protein  28.71 
 
 		 315 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2745  hypothetical protein  23.12 
 
 		 257 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451202  normal  0.356517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1353  hypothetical protein  26.48 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00990342  normal  0.0401411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2939  hypothetical protein  23.33 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2967  hypothetical protein  22.29 
 
 		 264 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.829543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3188  protein of unknown function DUF599  23.23 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1407  protein of unknown function DUF599  31.61 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2438  hypothetical protein  33.12 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.102666  normal  0.946287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2999  hypothetical protein  22.61 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1810  hypothetical protein  24.28 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3224  protein of unknown function DUF599  22.61 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.65288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>