37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0210 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0210  phage integrase family protein  100 
 
 
1273 aa  2645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250334  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4030  phage integrase family protein  100 
 
 
1273 aa  2645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.603699  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3888  phage integrase family protein  33.58 
 
 
1488 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3494  phage integrase family protein  40 
 
 
1172 aa  791    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3807  phage integrase family protein  34.11 
 
 
1433 aa  622  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0185  site-specific recombinase phage integrase family protein  31.6 
 
 
1106 aa  496  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1704  hypothetical protein  32.39 
 
 
982 aa  347  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654218  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0213  integrase family protein  30.8 
 
 
868 aa  270  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2725  integrase family protein  30.02 
 
 
869 aa  269  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100204  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2981  integrase family protein  30.02 
 
 
869 aa  269  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.37421  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2916  hypothetical protein  29.04 
 
 
889 aa  238  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0035  putative Phage integrase  27.08 
 
 
1018 aa  228  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.972071 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4378  phage integrase family protein  27.02 
 
 
1065 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.971134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0628  phage integrase family protein  27.02 
 
 
1065 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0725  phage integrase family protein  28.28 
 
 
999 aa  173  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0810  hypothetical protein  27.53 
 
 
1119 aa  160  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0162152  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6835  phage integrase family protein  32.26 
 
 
373 aa  72  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4275  hypothetical protein  25.08 
 
 
301 aa  63.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1668  hypothetical protein  23.23 
 
 
208 aa  55.1  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  31.62 
 
 
313 aa  49.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.38 
 
 
321 aa  46.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.68 
 
 
345 aa  46.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  37.1 
 
 
315 aa  46.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.68 
 
 
325 aa  45.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  27.34 
 
 
308 aa  45.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  32.29 
 
 
443 aa  45.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  42.37 
 
 
362 aa  45.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  37.88 
 
 
306 aa  45.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  42.37 
 
 
346 aa  45.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  40.98 
 
 
313 aa  45.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.31 
 
 
298 aa  45.1  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  41.38 
 
 
308 aa  45.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.62 
 
 
300 aa  45.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.62 
 
 
300 aa  45.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.62 
 
 
300 aa  45.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1743  Phage integrase  44.68 
 
 
270 aa  45.1  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  29.41 
 
 
317 aa  45.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>