20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0185 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0185  site-specific recombinase phage integrase family protein  100 
 
 		 1106 aa  2311    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3494  phage integrase family protein  33.01 
 
 		 1172 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4030  phage integrase family protein  31.65 
 
 		 1273 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.603699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0210  phage integrase family protein  31.65 
 
 		 1273 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250334  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3888  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 1488 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3807  phage integrase family protein  29.24 
 
 		 1433 aa  405  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1704  hypothetical protein  26.67 
 
 		 982 aa  273  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2981  integrase family protein  26 
 
 		 869 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.37421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2725  integrase family protein  26 
 
 		 869 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0035  putative Phage integrase  24.56 
 
 		 1018 aa  213  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.972071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0213  integrase family protein  24.97 
 
 		 868 aa  207  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2916  hypothetical protein  25.93 
 
 		 889 aa  206  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4378  phage integrase family protein  24.09 
 
 		 1065 aa  189  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.971134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0628  phage integrase family protein  24.09 
 
 		 1065 aa  189  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0725  phage integrase family protein  25.74 
 
 		 999 aa  141  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0810  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1119 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0162152  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6835  phage integrase family protein  24.31 
 
 		 373 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  26.19 
 
 		 362 aa  47.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 346 aa  46.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  34.92 
 
 		 315 aa  45.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>