17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2725 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0213  integrase family protein  67.26 
 
 		 868 aa  1177    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2981  integrase family protein  100 
 
 		 869 aa  1795    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.37421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2725  integrase family protein  100 
 
 		 869 aa  1795    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2916  hypothetical protein  38.48 
 
 		 889 aa  554  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1704  hypothetical protein  38.72 
 
 		 982 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0035  putative Phage integrase  31.49 
 
 		 1018 aa  313  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.972071 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4378  phage integrase family protein  30.74 
 
 		 1065 aa  297  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.971134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0628  phage integrase family protein  30.74 
 
 		 1065 aa  297  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4030  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 1273 aa  268  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.603699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0210  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 1273 aa  268  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3494  phage integrase family protein  28.34 
 
 		 1172 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0185  site-specific recombinase phage integrase family protein  26.3 
 
 		 1106 aa  221  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3888  phage integrase family protein  24.41 
 
 		 1488 aa  208  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3807  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 1433 aa  208  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0725  phage integrase family protein  26 
 
 		 999 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0810  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1119 aa  107  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0162152  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6835  phage integrase family protein  23.16 
 
 		 373 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>