19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3494 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3888  phage integrase family protein  34.24 
 
 		 1488 aa  654    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3494  phage integrase family protein  100 
 
 		 1172 aa  2449    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4030  phage integrase family protein  39.92 
 
 		 1273 aa  769    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.603699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0210  phage integrase family protein  39.92 
 
 		 1273 aa  769    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250334  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3807  phage integrase family protein  34.19 
 
 		 1433 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0185  site-specific recombinase phage integrase family protein  33.01 
 
 		 1106 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1704  hypothetical protein  32.25 
 
 		 982 aa  358  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0213  integrase family protein  27.94 
 
 		 868 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2981  integrase family protein  28.14 
 
 		 869 aa  253  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.37421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2725  integrase family protein  28.14 
 
 		 869 aa  253  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2916  hypothetical protein  27.53 
 
 		 889 aa  228  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4378  phage integrase family protein  28.6 
 
 		 1065 aa  199  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.971134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0628  phage integrase family protein  28.6 
 
 		 1065 aa  199  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0035  putative Phage integrase  26.12 
 
 		 1018 aa  191  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.972071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0725  phage integrase family protein  27.1 
 
 		 999 aa  147  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0810  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1119 aa  136  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0162152  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6835  phage integrase family protein  27.01 
 
 		 373 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1668  hypothetical protein  27.22 
 
 		 208 aa  52.8  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  41.1 
 
 		 395 aa  46.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>