19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3888 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3807  phage integrase family protein  82.51 
 
 		 1433 aa  2355    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3888  phage integrase family protein  100 
 
 		 1488 aa  3100    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3494  phage integrase family protein  34.67 
 
 		 1172 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0210  phage integrase family protein  33.9 
 
 		 1273 aa  635  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250334  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4030  phage integrase family protein  33.9 
 
 		 1273 aa  635  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.603699  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0185  site-specific recombinase phage integrase family protein  30.19 
 
 		 1106 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1704  hypothetical protein  27.89 
 
 		 982 aa  277  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0213  integrase family protein  26.35 
 
 		 868 aa  213  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2725  integrase family protein  24.41 
 
 		 869 aa  209  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2981  integrase family protein  24.41 
 
 		 869 aa  209  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.37421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2916  hypothetical protein  25.46 
 
 		 889 aa  195  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4378  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 1065 aa  187  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.971134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0628  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 1065 aa  187  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0035  putative Phage integrase  25.36 
 
 		 1018 aa  185  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.972071 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0810  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1119 aa  134  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0162152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0725  phage integrase family protein  25.38 
 
 		 999 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6835  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4275  hypothetical protein  25.94 
 
 		 301 aa  60.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1668  hypothetical protein  26.62 
 
 		 208 aa  57  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>