17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0628 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0035  putative Phage integrase  58.81 
 
 		 1018 aa  1233    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.972071 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0628  phage integrase family protein  100 
 
 		 1065 aa  2216    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4378  phage integrase family protein  100 
 
 		 1065 aa  2216    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.971134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1704  hypothetical protein  29.12 
 
 		 982 aa  295  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2981  integrase family protein  30.74 
 
 		 869 aa  282  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.37421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2725  integrase family protein  30.74 
 
 		 869 aa  282  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0213  integrase family protein  29.24 
 
 		 868 aa  273  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2916  hypothetical protein  27.47 
 
 		 889 aa  242  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0725  phage integrase family protein  27.31 
 
 		 999 aa  205  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4030  phage integrase family protein  26.75 
 
 		 1273 aa  199  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.603699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0210  phage integrase family protein  26.75 
 
 		 1273 aa  199  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3494  phage integrase family protein  28.6 
 
 		 1172 aa  199  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3807  phage integrase family protein  26.16 
 
 		 1433 aa  189  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3888  phage integrase family protein  26.66 
 
 		 1488 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0185  site-specific recombinase phage integrase family protein  23.94 
 
 		 1106 aa  187  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0810  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1119 aa  183  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0162152  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6835  phage integrase family protein  27.67 
 
 		 373 aa  99  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>