More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00144 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00144  Thiamine biosynthesis protein ThiF  100 
 
 
233 aa  478  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  37.39 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  39.47 
 
 
258 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.66 
 
 
253 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.22 
 
 
255 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  37.44 
 
 
252 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.72 
 
 
251 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  37.44 
 
 
252 aa  141  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  37.39 
 
 
257 aa  141  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.33 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.44 
 
 
251 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  36.12 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.89 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37 
 
 
259 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0127  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.77 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.96 
 
 
250 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.17 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4372  adenylyltransferase ThiF  36.12 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4405  adenylyltransferase ThiF  36.12 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.04 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.27 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0096  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.9 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  35.65 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.31 
 
 
266 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.19 
 
 
254 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.04 
 
 
255 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.76 
 
 
254 aa  135  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.61 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34373  predicted protein  40.43 
 
 
418 aa  135  7.000000000000001e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2100  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.86 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.84 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.47 
 
 
278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.03 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  36.68 
 
 
251 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.48 
 
 
256 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.68 
 
 
251 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0034  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.09 
 
 
249 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439342  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.68 
 
 
249 aa  131  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.09 
 
 
254 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.17 
 
 
255 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  38.36 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  38.58 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.12 
 
 
248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  38.54 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.48 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  35.53 
 
 
249 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4642  adenylyltransferase ThiF  33.04 
 
 
249 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.53 
 
 
249 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1811  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.4 
 
 
250 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.83 
 
 
252 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.35 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.62 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03864  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.62 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.12 
 
 
249 aa  128  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.84 
 
 
243 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.29 
 
 
253 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.91 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  35.22 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.3 
 
 
250 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1546  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.21 
 
 
251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.5 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.35 
 
 
250 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002074  sulfur carrier protein adenylyltransferase ThiF  37.39 
 
 
267 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00364  adenylyltransferase  36.55 
 
 
257 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.02 
 
 
252 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.83 
 
 
252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.91 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.61 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.31 
 
 
271 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  37.23 
 
 
252 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.83 
 
 
252 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.83 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.83 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.83 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.83 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.83 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0125  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.61 
 
 
253 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0188818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3872  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.74 
 
 
249 aa  125  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000483  molybdopterin biosynthesis protein B  33.04 
 
 
249 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.937598  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0131  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.61 
 
 
253 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000839209 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  33.48 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2094  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.55 
 
 
282 aa  124  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.77 
 
 
250 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.77 
 
 
250 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0137  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.17 
 
 
253 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0728  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.32 
 
 
247 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0735  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37 
 
 
251 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.5 
 
 
250 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.09 
 
 
247 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.23 
 
 
250 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.77 
 
 
274 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.07 
 
 
246 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000441041  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.3 
 
 
249 aa  122  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1936  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.21 
 
 
407 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.19 
 
 
256 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424886  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.22 
 
 
255 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.3 
 
 
250 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.63 
 
 
269 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0137  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.78 
 
 
254 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0776  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.44 
 
 
251 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>