113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1395 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1395  glutamate-cysteine ligase  100 
 
 
509 aa  1053    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2049  glutamate-cysteine ligase  35.02 
 
 
484 aa  257  3e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  35 
 
 
750 aa  226  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.07 
 
 
754 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0061  glutamate-cysteine ligase  30.23 
 
 
446 aa  177  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.398399  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.67 
 
 
757 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  27.03 
 
 
755 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  27.03 
 
 
755 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  25.36 
 
 
778 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  24.79 
 
 
778 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1975  Glutathione synthase  25 
 
 
462 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0781696 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03486  glutamate--cysteine ligase  25.16 
 
 
522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0201  glutamate--cysteine ligase  24.53 
 
 
523 aa  127  4.0000000000000003e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0090  glutamate--cysteine ligase  25.2 
 
 
524 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02763  glutamate cysteine ligase  25.47 
 
 
532 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.969679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1366  glutamate--cysteine ligase  25 
 
 
533 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0643  glutamate--cysteine ligase  24.95 
 
 
521 aa  123  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3207  glutamate--cysteine ligase  26.48 
 
 
517 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1120  glutamate--cysteine ligase  26.69 
 
 
517 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00403409  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002530  glutamate--cysteine ligase  25.05 
 
 
522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0987  glutamate--cysteine ligase  25.58 
 
 
520 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1002  glutamate--cysteine ligase  24.84 
 
 
518 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1557  glutamate--cysteine ligase  24.55 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0035  glutamate-cysteine ligase  25.06 
 
 
527 aa  110  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2654  glutamate-cysteine ligase  26.92 
 
 
536 aa  110  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.440832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1329  glutamate--cysteine ligase  26.93 
 
 
544 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.423999  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3260  glutamate--cysteine ligase  26.78 
 
 
549 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0043  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  25.06 
 
 
527 aa  108  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1031  glutamate--cysteine ligase  26.58 
 
 
549 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1132  glutamate--cysteine ligase  26.58 
 
 
549 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1058  glutamate--cysteine ligase  26.75 
 
 
526 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1098  glutamate--cysteine ligase  26.35 
 
 
549 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2810  glutamate--cysteine ligase  23.4 
 
 
518 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000302956  hitchhiker  0.00165416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3934  glutamate--cysteine ligase  23.4 
 
 
518 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.161519  normal  0.776675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02543  glutamate-cysteine ligase  23.4 
 
 
518 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0996  glutamate/cysteine ligase  23.4 
 
 
518 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02508  hypothetical protein  23.4 
 
 
518 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2824  glutamate--cysteine ligase  23.4 
 
 
518 aa  107  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00050885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1019  glutamate--cysteine ligase  23.4 
 
 
518 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.145998  normal  0.0132259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3188  glutamate--cysteine ligase  23.4 
 
 
518 aa  107  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00136573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3020  glutamate--cysteine ligase  22.98 
 
 
518 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.427194  hitchhiker  0.0000869019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3003  glutamate--cysteine ligase  22.98 
 
 
518 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179247  hitchhiker  0.000116011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2968  glutamate--cysteine ligase  22.98 
 
 
518 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209272  hitchhiker  0.00113196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2937  glutamate--cysteine ligase  22.98 
 
 
518 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247606  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3127  glutamate--cysteine ligase  22.98 
 
 
518 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.986087  normal  0.0373745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0847  glutamate--cysteine ligase  23.08 
 
 
520 aa  106  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000051454  hitchhiker  0.00000388875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2971  glutamate--cysteine ligase  24.04 
 
 
518 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000810543  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1208  glutamate--cysteine ligase  25.54 
 
 
522 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1219  glutamate--cysteine ligase  26.24 
 
 
524 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2980  glutamate--cysteine ligase  27.46 
 
 
549 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3326  glutamate--cysteine ligase  26.8 
 
 
542 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3559  glutamate--cysteine ligase  25.34 
 
 
564 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3062  glutamate--cysteine ligase  27.46 
 
 
549 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0750  glutamate--cysteine ligase  23.81 
 
 
530 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44822  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3168  glutamate--cysteine ligase  23.67 
 
 
514 aa  103  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1036  glutamate--cysteine ligase  26.94 
 
 
549 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0243  glutamate--cysteine ligase  24.95 
 
 
525 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3160  glutamate--cysteine ligase  25.77 
 
 
549 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.768452  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0258  glutamate--cysteine ligase  24.95 
 
 
530 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358158  normal  0.0162786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0255  glutamate--cysteine ligase  23.83 
 
 
535 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3369  glutamate--cysteine ligase  23.39 
 
 
532 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00208999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05020  glutamate--cysteine ligase  25.81 
 
 
530 aa  99  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3234  glutamate--cysteine ligase  23.39 
 
 
532 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314176  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0891  glutamate--cysteine ligase  23.39 
 
 
532 aa  98.6  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000207295  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0325  glutamate--cysteine ligase  25.2 
 
 
529 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1072  glutamate--cysteine ligase  26.14 
 
 
539 aa  97.8  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3373  glutamate--cysteine ligase  22.39 
 
 
526 aa  97.8  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1227  glutamate--cysteine ligase  26.79 
 
 
523 aa  97.1  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0268  glutamate--cysteine ligase  24.43 
 
 
530 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3086  glutamate--cysteine ligase  24.84 
 
 
547 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0401294  hitchhiker  0.00000000000210379 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0046  glutamate--cysteine ligase  26.2 
 
 
526 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2262  glutamate-cysteine ligase  23.08 
 
 
518 aa  93.6  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0149794  unclonable  0.0000000142325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4484  glutamate--cysteine ligase  26.09 
 
 
538 aa  93.6  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0203665  unclonable  0.00000138966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0257  glutamate--cysteine ligase  25.23 
 
 
532 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4969  glutamate--cysteine ligase  25.06 
 
 
525 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4078  glutamate--cysteine ligase  23.82 
 
 
529 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.479247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1606  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  26.1 
 
 
519 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.526422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0087  glutamate--cysteine ligase  24.15 
 
 
548 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000417414  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3583  glutamate-cysteine ligase  22.98 
 
 
530 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3202  glutamate--cysteine ligase  24.34 
 
 
537 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.676712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3637  glutamate/cysteine ligase  25.07 
 
 
518 aa  89.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3143  glutamate--cysteine ligase  24.22 
 
 
537 aa  89.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000827615 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3087  glutamate--cysteine ligase  24.17 
 
 
537 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00169886  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3953  glutamate--cysteine ligase  24.84 
 
 
538 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124779  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0324  glutamate--cysteine ligase  24.15 
 
 
548 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000109041  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0117  glutamate--cysteine ligase  24.15 
 
 
533 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000417338  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0118  glutamate--cysteine ligase  24.15 
 
 
537 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000414773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0134  glutamate--cysteine ligase  24.15 
 
 
537 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2834  glutamate--cysteine ligase  24.15 
 
 
537 aa  87.8  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000012706  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2251  glutamate--cysteine ligase  24.15 
 
 
537 aa  87.8  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0100341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2302  glutamate--cysteine ligase  24.15 
 
 
537 aa  87.8  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2325  glutamate--cysteine ligase  24.15 
 
 
537 aa  87.8  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82079  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1925  glutamate--cysteine ligase  23.19 
 
 
519 aa  87  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.196838 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2536  glutamate--cysteine ligase  24.45 
 
 
533 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0916365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3149  glutamate--cysteine ligase  24.45 
 
 
533 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0807881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3571  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  22.2 
 
 
518 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2471  glutamate--cysteine ligase  23.14 
 
 
509 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3169  glutamate--cysteine ligase  24.23 
 
 
537 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00288227  hitchhiker  0.00000108947 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2467  glutamate--cysteine ligase  25.61 
 
 
509 aa  85.1  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0110  glutamate/cysteine ligase  24.26 
 
 
532 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>