More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0379 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0379  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
168 aa  354  2.9999999999999997e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.156363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.61 
 
 
170 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  41.61 
 
 
170 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  41.61 
 
 
170 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.61 
 
 
170 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.61 
 
 
170 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.99 
 
 
170 aa  137  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  40.37 
 
 
170 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  40.37 
 
 
170 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  39.75 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 
178 aa  121  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.6 
 
 
171 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  36.6 
 
 
171 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  36.6 
 
 
171 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.6 
 
 
168 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.6 
 
 
168 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.6 
 
 
168 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.95 
 
 
168 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.95 
 
 
168 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.95 
 
 
168 aa  104  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  34.64 
 
 
168 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 
168 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  42.24 
 
 
164 aa  98.2  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.87 
 
 
176 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  32.9 
 
 
167 aa  84  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  37.4 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  37.21 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  37.88 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  32.19 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  29.86 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  29.86 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  33.1 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  36.46 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  32.52 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  36.46 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  32.52 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  36.28 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  28.36 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  33.64 
 
 
153 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2687  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
167 aa  62  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.793889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  30.82 
 
 
166 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 
167 aa  61.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
167 aa  61.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  34.31 
 
 
188 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  30.82 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  28.68 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  40.54 
 
 
270 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0899  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0605625  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  29.63 
 
 
164 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  34.65 
 
 
160 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
166 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
166 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0276  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  30.93 
 
 
165 aa  57.4  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  30.07 
 
 
162 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  31.07 
 
 
136 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  28.46 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  29.77 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1278  acyl-CoA hydrolase  39.02 
 
 
136 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76332  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  33.68 
 
 
141 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2709  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1200  thioesterase superfamily protein  36.45 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1140  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 
159 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  25.48 
 
 
327 aa  54.7  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.21 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  29.25 
 
 
131 aa  54.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>