225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0562 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0398  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  533  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0562  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  533  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  32.6 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  31.35 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  32.78 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  36.88 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  33.81 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  29.28 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  35 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  35.86 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  34.59 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  34.59 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  34.59 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  34.59 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  32.28 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  34.59 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  34.59 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  34.59 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  34.59 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  30.93 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1664  methyl-transferase  34.07 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2528  hypothetical protein  31.88 
 
 		 281 aa  62  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  24.8 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1480  methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00449789  normal  0.133133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  27.16 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4492  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.71 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.14 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  25.99 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1629  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.59 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.615509  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1444  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.59 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1535  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2020  methyltransferase type 11  24.88 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00106429  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002771  SAM-dependent methyltransferase  30.5 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531144  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03212  hypothetical protein  28.37 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.59 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.228971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  40 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  36.62 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  26.83 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2562  hypothetical protein  27.27 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0796  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.25 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  43.33 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2368  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000132187  normal  0.0100279 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.18 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2160  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000564941  normal  0.0553209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2237  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 240 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000104202  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  28.24 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  27.78 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 229 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 317 aa  48.9  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3512  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.14 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000892399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  28.23 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0146  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.844636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  40 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.35 
 
 		 503 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  39.71 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4129  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.03 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0406276  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.57 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1883  hypothetical protein  30.5 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0021884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1777  methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0781  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  38.57 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4117  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  39.71 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.930509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  40 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000587821  hitchhiker  0.0091617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2113  hypothetical protein  26.09 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  31.82 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.53 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1478  hypothetical protein  21.99 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  23.37 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.14 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2012  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000922882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.09 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.26 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1997  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00149539  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2060  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000118598  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>