77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1478 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1478  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  511  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1505  hypothetical protein  97.17 
 
 
247 aa  500  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  28.57 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  24.17 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2528  hypothetical protein  22.27 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  23.66 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  25.23 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  24.77 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  23.81 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  22.75 
 
 
273 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  23.98 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  24.62 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  23.11 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  24.23 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  21.9 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  23.91 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  24.52 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  23.79 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  21.43 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 
262 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  21.99 
 
 
233 aa  58.9  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  27.46 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  25.79 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  23.91 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  23.91 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  23.91 
 
 
270 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  25.32 
 
 
270 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  25.32 
 
 
270 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  25.32 
 
 
270 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  25.32 
 
 
270 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  25.32 
 
 
270 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  25.32 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  23.63 
 
 
273 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  25.32 
 
 
270 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  25.32 
 
 
270 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  23.81 
 
 
274 aa  55.8  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  26.21 
 
 
270 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  23.91 
 
 
270 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1480  methyltransferase type 11  23.11 
 
 
240 aa  55.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00449789  normal  0.133133 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  23.91 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  24.35 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1535  methyltransferase type 11  22.97 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  24.89 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  23.04 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  22.71 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1664  methyl-transferase  27.69 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  22.33 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  21.84 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  21.72 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  21.27 
 
 
252 aa  52  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  23.33 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  22.42 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  21.6 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1830  Methyltransferase type 11  21.3 
 
 
281 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  22.33 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  22.33 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  25.35 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
246 aa  49.3  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  21.84 
 
 
257 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  23.95 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  22 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  21.72 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  23.36 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0398  hypothetical protein  20.75 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0562  hypothetical protein  20.75 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  24.06 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  22.58 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1990  hypothetical protein  26.23 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000251541  hitchhiker  0.00000167474 
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  21.17 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0927  hypothetical protein  25.58 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  21.17 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  21.9 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  20.18 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  21.17 
 
 
259 aa  42.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>