More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1276 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1276  dihydropteroate synthase  100 
 
 
357 aa  717    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0665  dihydropteroate synthase  35.71 
 
 
379 aa  215  9e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1275  dihydropteroate synthase  36.87 
 
 
387 aa  212  7.999999999999999e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00183189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 
400 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  36.33 
 
 
356 aa  156  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  36.12 
 
 
402 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  31.6 
 
 
437 aa  143  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  35.66 
 
 
274 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  32.96 
 
 
270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  34.31 
 
 
266 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  34.49 
 
 
280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  34.36 
 
 
274 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  31.56 
 
 
407 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  33.59 
 
 
277 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  32.06 
 
 
278 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  31.67 
 
 
397 aa  138  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  33.83 
 
 
277 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  33.59 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  32.1 
 
 
290 aa  136  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  33.2 
 
 
277 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  30.55 
 
 
277 aa  135  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  33.2 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  33.2 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  33.2 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  32.9 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  33.2 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  33.2 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  33.84 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  32.82 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  30.55 
 
 
277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  30.55 
 
 
277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  31.94 
 
 
393 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  35.9 
 
 
279 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  33.58 
 
 
286 aa  132  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  28.77 
 
 
394 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  31.4 
 
 
286 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1716  dihydropteroate synthase  37.74 
 
 
300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  33.81 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  33.08 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  31.25 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  32.82 
 
 
277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  31.37 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  31.56 
 
 
280 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  30.58 
 
 
278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  30.82 
 
 
435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  31.99 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5465  dihydropteroate synthase  32.82 
 
 
286 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  31.82 
 
 
267 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  32.71 
 
 
289 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0005  dihydropteroate synthase  35.36 
 
 
395 aa  129  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00021463  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  32.35 
 
 
282 aa  129  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  34.13 
 
 
273 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  29.3 
 
 
400 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0254  dihydropteroate synthase  35.71 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00676186  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  33.45 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  31.99 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  31.99 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  31.99 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  31.99 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  31.99 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  31.99 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  31.99 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  31.99 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  33.09 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  30.43 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  31.83 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  33.97 
 
 
269 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  31.03 
 
 
264 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  30.48 
 
 
286 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
269 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  32 
 
 
303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  28.74 
 
 
277 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1099  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0210  dihydropteroate synthase  31.72 
 
 
299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  31.03 
 
 
264 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  30.4 
 
 
291 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0672  dihydropteroate synthase  30.5 
 
 
380 aa  126  6e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.999539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  29.26 
 
 
277 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  32.01 
 
 
282 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  32.01 
 
 
282 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  32.01 
 
 
282 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  32.01 
 
 
282 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.93 
 
 
436 aa  126  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  32.01 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  29.89 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  32.46 
 
 
283 aa  125  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1786  dihydropteroate synthase  35.5 
 
 
286 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  29.73 
 
 
259 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  33.09 
 
 
283 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  30.5 
 
 
287 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  30.06 
 
 
399 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0505  dihydropteroate synthase  29.87 
 
 
303 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.183245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  31.85 
 
 
283 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1386  dihydropteroate synthase  35.09 
 
 
279 aa  125  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0675469  hitchhiker  0.00645369 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  31.06 
 
 
258 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  31.15 
 
 
290 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  31.46 
 
 
396 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
278 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>