More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0254 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0254  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 293 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00676186  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  53.26 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1514  dihydropteroate synthase  54.61 
 
 		 286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0169529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1786  dihydropteroate synthase  55.3 
 
 		 286 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0056  dihydropteroate synthase  49.83 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1716  dihydropteroate synthase  51.8 
 
 		 300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  51.92 
 
 		 271 aa  245  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  49.19 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  48.81 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  42.11 
 
 		 280 aa  216  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  48.3 
 
 		 284 aa  211  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  41.01 
 
 		 376 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 		 397 aa  209  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  41.91 
 
 		 274 aa  208  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  44.92 
 
 		 279 aa  208  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  43.2 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  46.48 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  43.02 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  39.92 
 
 		 281 aa  203  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  42.59 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 		 270 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0439  dihydropteroate synthase  46.06 
 
 		 385 aa  202  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00392867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  45.66 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 275 aa  201  9e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  45.53 
 
 		 436 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  43.8 
 
 		 413 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  41.83 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  41.15 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  40.7 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  41.83 
 
 		 277 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  43.31 
 
 		 282 aa  199  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  42.35 
 
 		 277 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  44 
 
 		 298 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  42.35 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  43.2 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  47.77 
 
 		 435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  39.15 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  41.48 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  41.57 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  41.96 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  40.7 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  42.6 
 
 		 400 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  40.31 
 
 		 264 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 		 275 aa  196  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 277 aa  195  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 277 aa  195  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  40.82 
 
 		 280 aa  196  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  41.44 
 
 		 277 aa  195  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  41.11 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  41.2 
 
 		 277 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2876  dihydropteroate synthase  44.78 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0307138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  41.1 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1911  dihydropteroate synthase  45.31 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  44.09 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  40.08 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  41.29 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  38.73 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  42.34 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  39.7 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  40.23 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  43.64 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  43.08 
 
 		 437 aa  192  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  45.78 
 
 		 291 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2618  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.103274  normal  0.519468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 296 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 296 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 296 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 296 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  42.34 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  46.06 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  41.26 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  41.78 
 
 		 394 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1263  dihydropteroate synthase  43.8 
 
 		 270 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  40.94 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  40.16 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  42.59 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 		 486 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  41.01 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  43.06 
 
 		 283 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  41.01 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  45.21 
 
 		 280 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>