More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1716 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1716  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1514  dihydropteroate synthase  60.51 
 
 		 286 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0169529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1786  dihydropteroate synthase  59.71 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  54.71 
 
 		 289 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0056  dihydropteroate synthase  50.63 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0254  dihydropteroate synthase  51.61 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00676186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  48.06 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 		 291 aa  215  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  39.43 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  43.41 
 
 		 277 aa  201  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  40.3 
 
 		 376 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  40.15 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  41.47 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  41.09 
 
 		 277 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  41.09 
 
 		 277 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  43.41 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 		 279 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0420  dihydropteroate synthase  43.22 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0615939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  40.54 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  40.86 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  44.87 
 
 		 402 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  38.11 
 
 		 270 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  40.89 
 
 		 437 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  41.86 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  39 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  47.45 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  47.47 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  39.15 
 
 		 282 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  43.02 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  40.89 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  40.78 
 
 		 274 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0945  dihydropteroate synthase  46.04 
 
 		 279 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  37.84 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  39.23 
 
 		 280 aa  185  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1386  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0675469  hitchhiker  0.00645369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  38.66 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  38.66 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  38.66 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  38.66 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  38.66 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  38.66 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  38.66 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  38.66 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  46.75 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  39.53 
 
 		 277 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  37.45 
 
 		 356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5465  dihydropteroate synthase  40.78 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  39.7 
 
 		 280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  36.57 
 
 		 397 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  45.67 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  45.12 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09371  putative dihydropteroate synthase  35.82 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783824 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  38.66 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  42.41 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0510  dihydropteroate synthase  42.31 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  40.23 
 
 		 400 aa  183  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  40.74 
 
 		 436 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  38.76 
 
 		 282 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0439  dihydropteroate synthase  44.31 
 
 		 385 aa  181  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00392867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  39.15 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  40.98 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  39.15 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 		 435 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  40.66 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  38.76 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  38.76 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  38.76 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  38.91 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  39.34 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  42.49 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  43.9 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  40.82 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  44.9 
 
 		 265 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  38.97 
 
 		 277 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  43.09 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  43.46 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  38.37 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  38.97 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  38.97 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  40.7 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  34.95 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  37.87 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  38.82 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  38.46 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  40.94 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  38.46 
 
 		 277 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  41.22 
 
 		 394 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  39.46 
 
 		 277 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0499  dihydropteroate synthase  40.93 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.491755  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  36.79 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2625  dihydropteroate synthase  43.46 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4924  dihydropteroate synthase  43.92 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>