More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0665 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0665  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 379 aa  782    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1275  dihydropteroate synthase  57.26 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00183189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1276  dihydropteroate synthase  35.71 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  36.43 
 
 		 279 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  37 
 
 		 277 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  37.59 
 
 		 280 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  37.59 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  37.22 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  37.22 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 		 277 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  34.7 
 
 		 276 aa  176  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 		 277 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 		 278 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  33.84 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  37.12 
 
 		 258 aa  173  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  34.46 
 
 		 274 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  36.8 
 
 		 437 aa  172  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  36.7 
 
 		 286 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  36.47 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  34.19 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  34.78 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  35.45 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  34.47 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  34.35 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  35.31 
 
 		 436 aa  168  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  32.72 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 		 259 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  34.29 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  32.7 
 
 		 277 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  30.43 
 
 		 400 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  33.08 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  33.85 
 
 		 283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  34.75 
 
 		 286 aa  166  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  32.72 
 
 		 277 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 		 280 aa  166  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  32.72 
 
 		 277 aa  166  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  33.72 
 
 		 267 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  33.97 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  31.41 
 
 		 282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  31.95 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  33.85 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  32.72 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  31.37 
 
 		 277 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  31.37 
 
 		 277 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  31.18 
 
 		 277 aa  162  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  33.9 
 
 		 810 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  34.89 
 
 		 287 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  31.87 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  31.85 
 
 		 277 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  33.72 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  32.57 
 
 		 277 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  31.1 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  34.34 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  33.59 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  31.37 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  34.47 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  33.84 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  33.84 
 
 		 282 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  33.84 
 
 		 282 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  35.02 
 
 		 279 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  33.84 
 
 		 282 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  31.2 
 
 		 277 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  34.62 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  32.97 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  32.97 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  33.97 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  32.35 
 
 		 277 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  32.58 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  32.72 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  31.99 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  34.43 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  35.09 
 
 		 278 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  33.08 
 
 		 282 aa  157  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  34.72 
 
 		 269 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  35.09 
 
 		 278 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  32.41 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  31.56 
 
 		 282 aa  156  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  31.56 
 
 		 282 aa  156  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  31.56 
 
 		 282 aa  156  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  31.56 
 
 		 282 aa  156  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  35.27 
 
 		 292 aa  156  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  31.56 
 
 		 282 aa  156  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  31.56 
 
 		 282 aa  156  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  31.56 
 
 		 282 aa  156  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 		 282 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  31.56 
 
 		 282 aa  156  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  32.83 
 
 		 276 aa  156  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2610  dihydropteroate synthase  32.41 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  34.72 
 
 		 269 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  30.8 
 
 		 282 aa  155  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2876  dihydropteroate synthase  32.58 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0307138  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  31.56 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  32.08 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  32.45 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  32.95 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  30.88 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  32.95 
 
 		 283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  34.46 
 
 		 275 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>