More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0234 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0234  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  233  8e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  60.17 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  59.66 
 
 
118 aa  143  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  44.54 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  47.01 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  43.22 
 
 
120 aa  101  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  42.02 
 
 
124 aa  100  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  41.82 
 
 
117 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1233  iojap-like protein  52.14 
 
 
118 aa  98.6  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000702287  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  40.18 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  39.47 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1649  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1684  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0432873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  41.23 
 
 
118 aa  94.7  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  40.54 
 
 
118 aa  92  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1401  Iojap family protein  40.35 
 
 
121 aa  92  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131748  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  43.93 
 
 
110 aa  92  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  38.79 
 
 
115 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  39.82 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  42.86 
 
 
116 aa  88.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  43.27 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  37.17 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  43.88 
 
 
198 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  43.88 
 
 
198 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3359  iojap-like protein  40.54 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  45.13 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  38.53 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  36.94 
 
 
112 aa  84.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  38.89 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  39.64 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  41 
 
 
191 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  36.7 
 
 
114 aa  84  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  35.45 
 
 
113 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  34.51 
 
 
144 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3056  iojap-like protein  45 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000232499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  48 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  38.94 
 
 
115 aa  83.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  40.74 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  40.57 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3449  iojap-like protein  41.41 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467632  normal  0.645308 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  37.84 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  40.2 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  40.37 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  47.57 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  43.69 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  42.59 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  41.44 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  40.37 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  34.51 
 
 
144 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4450  iojap-related protein  44.74 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0295288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  39.09 
 
 
134 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0787  iojap-related protein  44.74 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000071595  hitchhiker  0.00000138621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  40.37 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  38.39 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  43.16 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  0.0000000000582879 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  39.64 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  40.37 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  41.67 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  35.65 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4181  iojap-like protein  46.09 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000680321  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  34.86 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  37.96 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4411  iojap-related protein  46.09 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0836383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4066  iojap-related protein  46.09 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.08408e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4076  iojap-related protein  46.09 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000293892  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  37.5 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  39.25 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4352  iojap-related protein  46.09 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4463  iojap-related protein  46.09 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  43.75 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7257  iojap-like protein  42.86 
 
 
173 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4228  iojap-related protein  46.09 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4556  iojap-related protein  46.09 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  36.94 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  37.04 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  38.1 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12550  iojap-related protein  41.84 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.679587  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  34.26 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  40.78 
 
 
117 aa  80.1  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  35.45 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  35.78 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  36.61 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  39.25 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2274  iojap-like protein  40.4 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000201224  hitchhiker  0.000438261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  39.25 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  36.7 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  38.24 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  40.37 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  37.17 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  36.7 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  38.83 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09441  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  32.23 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.120716  hitchhiker  0.0000153571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  34.86 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  39.25 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  36.79 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  36.79 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  36.79 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  39 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  37.14 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>