254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4162 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4162  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 		 225 aa  421  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  71.3 
 
 		 238 aa  262  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.789001 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0832  deoxyribose-phosphate aldolase  65.28 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1003  deoxyribose-phosphate aldolase  64.98 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4728  deoxyribose-phosphate aldolase  63.21 
 
 		 221 aa  242  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21200  deoxyribose-phosphate aldolase  65.38 
 
 		 221 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25660  deoxyribose-phosphate aldolase  63.3 
 
 		 240 aa  238  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107736  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0787  deoxyribose-phosphate aldolase  62.56 
 
 		 225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0811  deoxyribose-phosphate aldolase  68.02 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0097  deoxyribose-phosphate aldolase  66.22 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0688  deoxyribose-phosphate aldolase  55.7 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.336126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0646  deoxyribose-phosphate aldolase  63.35 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0659  deoxyribose-phosphate aldolase  63.35 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.156443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0639  deoxyribose-phosphate aldolase  62.9 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.0436626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5921  deoxyribose-phosphate aldolase  50 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3653  deoxyribose-phosphate aldolase  56.47 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10486  deoxyribose-phosphate aldolase  67.12 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.235574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  45.79 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  52.58 
 
 		 409 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  47.2 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  45.21 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  44.39 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  46.01 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  51.4 
 
 		 238 aa  177  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  44.91 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  44.44 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  43.93 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  44.24 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  40.55 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  43.98 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  48.43 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  50 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  49.3 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  41.67 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  43.64 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  43.32 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  43.4 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  41.67 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  43.19 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  43.46 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  43.19 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  43.46 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3002  deoxyribose-phosphate aldolase  46.12 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00170896 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  44.04 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1301  deoxyribose-phosphate aldolase  50.23 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  41.51 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  43.87 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  43.4 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  43.4 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  43.4 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  47.89 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  43.4 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2600  deoxyribose-phosphate aldolase  49.53 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  43.4 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  42.92 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  43.12 
 
 		 248 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  42.92 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  43.4 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  43.12 
 
 		 248 aa  158  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3719  deoxyribose-phosphate aldolase  42.2 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.485084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  43.93 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  41.2 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  42.99 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  45.71 
 
 		 317 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  40.65 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  44.5 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1951  deoxyribose-phosphate aldolase  43.12 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  42.59 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  39.25 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  42.45 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  43.19 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08130  deoxyribose-phosphate aldolase  45.34 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  39.25 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  41.59 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  39.44 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3216  deoxyribose-phosphate aldolase  48.36 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  37.44 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  44.91 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  37.16 
 
 		 219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  37.67 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  44.55 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  39.91 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  45.41 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0572  deoxyribose-phosphate aldolase  47 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2967  deoxyribose-phosphate aldolase  43.23 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0574826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  43.38 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  41.78 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2818  deoxyribose-phosphate aldolase  48.11 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.964115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  41.78 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1632  deoxyribose-phosphate aldolase  43.78 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101131  hitchhiker  0.000603292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  36.54 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2652  deoxyribose-phosphate aldolase  43.58 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7285  deoxyribose-phosphate aldolase  41.98 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1556  deoxyribose-phosphate aldolase  43.58 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2737  deoxyribose-phosphate aldolase  43.58 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  41.85 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  39.91 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  40.62 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1583  deoxyribose-phosphate aldolase  38.83 
 
 		 222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2070  deoxyribose-phosphate aldolase  40.58 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.661265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>