254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0787 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0787  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 
225 aa  437  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3653  deoxyribose-phosphate aldolase  63.95 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4728  deoxyribose-phosphate aldolase  60.65 
 
 
221 aa  231  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0811  deoxyribose-phosphate aldolase  60.71 
 
 
225 aa  224  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0646  deoxyribose-phosphate aldolase  62.39 
 
 
226 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0659  deoxyribose-phosphate aldolase  62.39 
 
 
226 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.156443  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0639  deoxyribose-phosphate aldolase  61.93 
 
 
226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.0436626 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21200  deoxyribose-phosphate aldolase  60.91 
 
 
221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  60.45 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.789001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0097  deoxyribose-phosphate aldolase  61.64 
 
 
225 aa  208  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247733  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25660  deoxyribose-phosphate aldolase  56.14 
 
 
240 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107736  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4162  deoxyribose-phosphate aldolase  62.56 
 
 
225 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1003  deoxyribose-phosphate aldolase  57.67 
 
 
236 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0832  deoxyribose-phosphate aldolase  54.55 
 
 
236 aa  202  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10486  deoxyribose-phosphate aldolase  61.93 
 
 
224 aa  201  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.235574  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0688  deoxyribose-phosphate aldolase  52.38 
 
 
260 aa  185  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.336126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5921  deoxyribose-phosphate aldolase  47.16 
 
 
256 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  46.79 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  44.44 
 
 
217 aa  159  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  44.55 
 
 
223 aa  158  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  47.62 
 
 
233 aa  158  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  44.09 
 
 
220 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  39.11 
 
 
224 aa  156  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  48.67 
 
 
238 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  47.14 
 
 
229 aa  155  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  42.34 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  43.52 
 
 
223 aa  154  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  46.82 
 
 
247 aa  154  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  41.89 
 
 
224 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  43.52 
 
 
223 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  43.52 
 
 
223 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  43.52 
 
 
223 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  43.52 
 
 
223 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  43.52 
 
 
223 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  43.52 
 
 
223 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  43.52 
 
 
223 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  43.06 
 
 
223 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  43.06 
 
 
223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  40.72 
 
 
223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  43.06 
 
 
223 aa  151  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  42.2 
 
 
220 aa  150  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  46.73 
 
 
317 aa  149  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  39.91 
 
 
228 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  42.2 
 
 
221 aa  148  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  42.41 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  42.27 
 
 
226 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  38.12 
 
 
219 aa  145  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  44.24 
 
 
226 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  46.08 
 
 
220 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  45.5 
 
 
409 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  42.25 
 
 
220 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  40.09 
 
 
231 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  43.46 
 
 
223 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  42.47 
 
 
220 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  42.47 
 
 
220 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  38.99 
 
 
215 aa  141  9e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  42.59 
 
 
220 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1301  deoxyribose-phosphate aldolase  44.75 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113978 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  42.59 
 
 
220 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  40.54 
 
 
221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  42.66 
 
 
248 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  39.45 
 
 
220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1951  deoxyribose-phosphate aldolase  44.29 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  44.75 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  43.89 
 
 
226 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  45.41 
 
 
222 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  43.96 
 
 
212 aa  136  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  42.2 
 
 
248 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  41.13 
 
 
233 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  40.09 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08130  deoxyribose-phosphate aldolase  41.95 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  40.54 
 
 
224 aa  135  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2652  deoxyribose-phosphate aldolase  42.66 
 
 
223 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3002  deoxyribose-phosphate aldolase  43.18 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00170896 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  37.16 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2737  deoxyribose-phosphate aldolase  42.66 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1556  deoxyribose-phosphate aldolase  42.66 
 
 
223 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  41.44 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0114  deoxyribose-phosphate aldolase  39.73 
 
 
221 aa  132  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1632  deoxyribose-phosphate aldolase  44.05 
 
 
226 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101131  hitchhiker  0.000603292 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3216  deoxyribose-phosphate aldolase  45.16 
 
 
220 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  39.46 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3719  deoxyribose-phosphate aldolase  40.44 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.485084  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  43.06 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0572  deoxyribose-phosphate aldolase  42.98 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.574105  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2538  deoxyribose-phosphate aldolase  40.64 
 
 
223 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  39.74 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2141  deoxyribose-phosphate aldolase  44.39 
 
 
215 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00973111  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  39.19 
 
 
241 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  40.17 
 
 
235 aa  128  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  35.62 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  34.74 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  41.33 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  37.96 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  44.8 
 
 
424 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2070  deoxyribose-phosphate aldolase  38.76 
 
 
223 aa  126  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.661265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7285  deoxyribose-phosphate aldolase  39.25 
 
 
215 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  41.82 
 
 
248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  35.43 
 
 
249 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0977  deoxyribose-phosphate aldolase  43.13 
 
 
228 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.593139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>