More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1236 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1762  nitrate reductase, beta subunit  66.04 
 
 		 566 aa  696    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00378807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4477  nitrate reductase, beta subunit  62.01 
 
 		 526 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.619422  normal  0.432155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3700  nitrate reductase, beta subunit  62.05 
 
 		 554 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5442  nitrate reductase (beta subunit)  66.39 
 
 		 553 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1978  respiratory nitrate reductase subunit beta  62.01 
 
 		 491 aa  660    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1955  respiratory nitrate reductase, beta subunit  62.22 
 
 		 491 aa  660    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1933  respiratory nitrate reductase, beta subunit  62.42 
 
 		 491 aa  661    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.287323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0901  nitrate reductase, beta subunit  61.34 
 
 		 561 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1825  nitrate reductase, beta subunit  66.46 
 
 		 559 aa  700    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41544  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2039  nitrate reductase, beta subunit  69.52 
 
 		 511 aa  748    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3674  nitrate reductase, beta subunit  61.13 
 
 		 561 aa  651    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00364422  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1236  nitrate reductase, beta subunit  100 
 
 		 507 aa  1060    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.222412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3139  nitrate reductase, beta subunit  62.71 
 
 		 576 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250265  hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1262  respiratory nitrate reductase beta subunit  63.86 
 
 		 551 aa  665    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1206  respiratory nitrate reductase beta subunit  60.5 
 
 		 538 aa  637    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1490  nitrate reductase, beta subunit  63.21 
 
 		 519 aa  673    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0315  respiratory nitrate reductase beta subunit  64.46 
 
 		 557 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0508  respiratory nitrate reductase beta subunit  64.73 
 
 		 549 aa  670    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.408187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1347  respiratory nitrate reductase beta subunit  64.94 
 
 		 584 aa  708    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11187  respiratory nitrate reductase beta subunit narH  62.01 
 
 		 558 aa  688    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1279  respiratory nitrate reductase beta subunit  63.86 
 
 		 551 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.319698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4545  nitrate reductase, beta subunit  63.47 
 
 		 550 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18710  respiratory nitrate reductase beta subunit  64.21 
 
 		 544 aa  701    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0498038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3400  nitrate reductase, beta subunit  61.81 
 
 		 491 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4428  nitrate reductase, beta subunit  63.75 
 
 		 588 aa  684    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5212  nitrate reductase subunit beta  63.54 
 
 		 560 aa  658    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  0.717062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2804  nitrate reductase, beta subunit  65.62 
 
 		 558 aa  695    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.477441  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1288  nitrate reductase, beta subunit  63.86 
 
 		 551 aa  664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1923  nitrate reductase (beta subunit)  61.28 
 
 		 543 aa  677    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1972  nitrate reductase, beta subunit  62.22 
 
 		 491 aa  658    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.991087  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2157  nitrate reductase, beta subunit  62.96 
 
 		 550 aa  693    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0193  nitrate reductase, beta subunit  68.6 
 
 		 539 aa  715    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0137302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0178  nitrate reductase, beta subunit  68.61 
 
 		 539 aa  731    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2636  nitrate reductase, beta subunit  60.49 
 
 		 489 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2420  nitrate reductase, beta subunit  58.76 
 
 		 519 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2468  nitrate reductase, beta subunit  58.76 
 
 		 519 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3865  nitrate reductase, beta subunit  54.13 
 
 		 507 aa  601  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4235  nitrate reductase, beta subunit  56.43 
 
 		 505 aa  604  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.312126  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5003  respiratory nitrate reductase beta subunit  54.8 
 
 		 515 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1853  nitrate reductase, beta subunit  54.22 
 
 		 517 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1986  respiratory nitrate reductase, beta subunit  56.32 
 
 		 517 aa  597  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1732  nitrate reductase, beta subunit  54.22 
 
 		 517 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2758  nitrate reductase, beta subunit  54.42 
 
 		 517 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2235  nitrate reductase, beta subunit  55.67 
 
 		 514 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3593  nitrate reductase, beta subunit  55.2 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.177223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3179  respiratory nitrate reductase, beta subunit  61.25 
 
 		 453 aa  594  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2075  respiratory nitrate reductase subunit beta  54.69 
 
 		 517 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2242  nitrate reductase, beta subunit  54.22 
 
 		 517 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0484783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3076  nitrate reductase, beta subunit  54.22 
 
 		 517 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2626  nitrate reductase, beta subunit  54.42 
 
 		 517 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2682  nitrate reductase, beta subunit  54.42 
 
 		 517 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1515  nitrate reductase, beta subunit  54.22 
 
 		 517 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4670  nitrate reductase, beta subunit  55.2 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2159  respiratory nitrate reductase, beta subunit  61.02 
 
 		 453 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0975  respiratory nitrate reductase oxidoreductase protein  54.2 
 
 		 515 aa  591  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2126  respiratory nitrate reductase subunit beta  60.58 
 
 		 453 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0428  nitrate reductase, beta subunit  53.77 
 
 		 507 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.090133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4594  respiratory nitrate reductase beta subunit  54.24 
 
 		 510 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0437  respiratory nitrate reductase beta subunit  53.77 
 
 		 507 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0538175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2276  respiratory nitrate reductase, beta subunit  60.8 
 
 		 453 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.434638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2136  respiratory nitrate reductase, beta subunit  61.25 
 
 		 453 aa  593  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1002  respiratory nitrate reductase beta subunit  54.27 
 
 		 527 aa  589  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2705  respiratory nitrate reductase beta subunit  54.12 
 
 		 508 aa  588  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.59941  normal  0.077732 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2519  nitrate reductase, beta subunit  54.71 
 
 		 508 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  0.84462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1110  nitrate reductase, beta subunit  53.32 
 
 		 513 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1707  respiratory nitrate reductase beta subunit  54.24 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1509  nitrate reductase, beta subunit  52.99 
 
 		 504 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2793  nitrate reductase, beta subunit  53.21 
 
 		 507 aa  587  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5683  nitrate reductase, beta subunit  54.9 
 
 		 509 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6185  nitrate reductase, beta subunit  53.17 
 
 		 507 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.950636  normal  0.0269219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0662  respiratory nitrate reductase beta subunit  53.37 
 
 		 507 aa  587  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.21299  normal  0.287133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3760  nitrate reductase, beta subunit  53.06 
 
 		 510 aa  586  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.281422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2633  nitrate reductase, beta subunit  53.78 
 
 		 512 aa  585  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.56399  normal  0.025961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2258  nitrate reductase, beta subunit  53.81 
 
 		 521 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0667  nitrate reductase, beta subunit  53.71 
 
 		 512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1404  respiratory nitrate reductase beta subunit  54.44 
 
 		 522 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314304  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1695  nitrate reductase 2, beta subunit  53.75 
 
 		 514 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.401528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1582  nitrate reductase, beta subunit  54.85 
 
 		 508 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000310576  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1331  respiratory nitrate reductase beta subunit  53.35 
 
 		 519 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1235  nitrate reductase subunit beta  53.49 
 
 		 513 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13800  respiratory nitrate reductase beta subuni  53.49 
 
 		 513 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6463  nitrate reductase, beta subunit  55.24 
 
 		 511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2063  respiratory nitrate reductase beta subunit  55 
 
 		 514 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1756  nitrate reductase 2 subunit beta  53.33 
 
 		 514 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1693  nitrate reductase 2, beta subunit  53.33 
 
 		 514 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.595471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1764  nitrate reductase 2 subunit beta  53.54 
 
 		 514 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.939627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2227  respiratory nitrate reductase beta subunit  53.4 
 
 		 512 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.414586  normal  0.0461834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2303  respiratory nitrate reductase beta subunit  53.4 
 
 		 512 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.932469  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2882  nitrate reductase, beta subunit  53.14 
 
 		 514 aa  581  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5710  nitrate reductase, beta subunit  54.83 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2591  nitrate reductase, beta subunit  51.75 
 
 		 509 aa  581  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01425  nitrate reductase 2 (NRZ), beta subunit  53.12 
 
 		 514 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1648  nitrate reductase, beta subunit  53.12 
 
 		 514 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2180  nitrate reductase, beta subunit  53.33 
 
 		 514 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01437  hypothetical protein  53.12 
 
 		 514 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5384  nitrate reductase, beta subunit  53.8 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302612  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1583  nitrate reductase 2, beta subunit  53.12 
 
 		 514 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2189  nitrate reductase, beta subunit  53.33 
 
 		 514 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1707  nitrate reductase 2, beta subunit  53.33 
 
 		 514 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.764488 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2314  respiratory nitrate reductase beta subunit  54.56 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>