More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3700 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5442  nitrate reductase (beta subunit)  70.63 
 
 		 553 aa  811    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4428  nitrate reductase, beta subunit  70.81 
 
 		 588 aa  826    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11187  respiratory nitrate reductase beta subunit narH  67.93 
 
 		 558 aa  815    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0901  nitrate reductase, beta subunit  70.76 
 
 		 561 aa  823    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2039  nitrate reductase, beta subunit  64.67 
 
 		 511 aa  679    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3700  nitrate reductase, beta subunit  100 
 
 		 554 aa  1151    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0193  nitrate reductase, beta subunit  57.22 
 
 		 539 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0137302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1923  nitrate reductase (beta subunit)  69.4 
 
 		 543 aa  827    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1762  nitrate reductase, beta subunit  66.36 
 
 		 566 aa  773    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00378807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1262  respiratory nitrate reductase beta subunit  71.4 
 
 		 551 aa  823    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4477  nitrate reductase, beta subunit  67.74 
 
 		 526 aa  755    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.619422  normal  0.432155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3674  nitrate reductase, beta subunit  70.94 
 
 		 561 aa  828    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00364422  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0315  respiratory nitrate reductase beta subunit  80.91 
 
 		 557 aa  934    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0508  respiratory nitrate reductase beta subunit  61.25 
 
 		 549 aa  693    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.408187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18710  respiratory nitrate reductase beta subunit  63.77 
 
 		 544 aa  739    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0498038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1347  respiratory nitrate reductase beta subunit  69.58 
 
 		 584 aa  835    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1279  respiratory nitrate reductase beta subunit  71.4 
 
 		 551 aa  823    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.319698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4545  nitrate reductase, beta subunit  71.53 
 
 		 550 aa  835    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2804  nitrate reductase, beta subunit  68.43 
 
 		 558 aa  785    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.477441  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1490  nitrate reductase, beta subunit  62.24 
 
 		 519 aa  647    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1236  nitrate reductase, beta subunit  62.05 
 
 		 507 aa  692    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.222412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1288  nitrate reductase, beta subunit  71.4 
 
 		 551 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2157  nitrate reductase, beta subunit  70.09 
 
 		 550 aa  852    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3139  nitrate reductase, beta subunit  64.48 
 
 		 576 aa  746    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250265  hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0178  nitrate reductase, beta subunit  60.61 
 
 		 539 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5212  nitrate reductase subunit beta  69.37 
 
 		 560 aa  790    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  0.717062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1825  nitrate reductase, beta subunit  66.97 
 
 		 559 aa  780    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1955  respiratory nitrate reductase, beta subunit  56.01 
 
 		 491 aa  623  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1933  respiratory nitrate reductase, beta subunit  56.01 
 
 		 491 aa  623  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.287323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2636  nitrate reductase, beta subunit  58.78 
 
 		 489 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1972  nitrate reductase, beta subunit  55.8 
 
 		 491 aa  623  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.991087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1978  respiratory nitrate reductase subunit beta  55.8 
 
 		 491 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1206  respiratory nitrate reductase beta subunit  59.88 
 
 		 538 aa  620  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3400  nitrate reductase, beta subunit  55.6 
 
 		 491 aa  615  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1986  respiratory nitrate reductase, beta subunit  58.6 
 
 		 517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3760  nitrate reductase, beta subunit  56.23 
 
 		 510 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.281422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2420  nitrate reductase, beta subunit  55.82 
 
 		 519 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2468  nitrate reductase, beta subunit  55.82 
 
 		 519 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0662  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.84 
 
 		 507 aa  601  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.21299  normal  0.287133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4594  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.84 
 
 		 510 aa  598  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1707  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.36 
 
 		 510 aa  595  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1695  nitrate reductase 2, beta subunit  56.82 
 
 		 514 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.401528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0667  nitrate reductase, beta subunit  55.98 
 
 		 512 aa  592  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6185  nitrate reductase, beta subunit  56.61 
 
 		 507 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.950636  normal  0.0269219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1693  nitrate reductase 2, beta subunit  57.03 
 
 		 514 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.595471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1583  nitrate reductase 2, beta subunit  56.82 
 
 		 514 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1764  nitrate reductase 2 subunit beta  56.82 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.939627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1756  nitrate reductase 2 subunit beta  56.82 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1853  nitrate reductase, beta subunit  55.69 
 
 		 517 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01425  nitrate reductase 2 (NRZ), beta subunit  56.45 
 
 		 514 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1648  nitrate reductase, beta subunit  56.45 
 
 		 514 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2180  nitrate reductase, beta subunit  56.45 
 
 		 514 aa  586  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109397  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0428  nitrate reductase, beta subunit  53.82 
 
 		 507 aa  587  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.090133  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01437  hypothetical protein  56.45 
 
 		 514 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0606  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.98 
 
 		 512 aa  588  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1551  nitrate reductase, beta subunit  56.45 
 
 		 514 aa  586  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0437  respiratory nitrate reductase beta subunit  53.82 
 
 		 507 aa  586  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0538175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2591  nitrate reductase, beta subunit  55.43 
 
 		 509 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1707  nitrate reductase 2, beta subunit  56.45 
 
 		 514 aa  586  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.764488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2189  nitrate reductase, beta subunit  56.45 
 
 		 514 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2077  nitrate reductase 2, beta subunit  56.45 
 
 		 514 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1582  nitrate reductase, beta subunit  54.67 
 
 		 508 aa  585  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000310576  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0975  respiratory nitrate reductase oxidoreductase protein  52.94 
 
 		 515 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1732  nitrate reductase, beta subunit  54.89 
 
 		 517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5003  respiratory nitrate reductase beta subunit  54.42 
 
 		 515 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2758  nitrate reductase, beta subunit  55.09 
 
 		 517 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1235  nitrate reductase subunit beta  54.35 
 
 		 513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2793  nitrate reductase, beta subunit  53.62 
 
 		 507 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13800  respiratory nitrate reductase beta subuni  54.35 
 
 		 513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4670  nitrate reductase, beta subunit  54.1 
 
 		 514 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3593  nitrate reductase, beta subunit  54.1 
 
 		 514 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.177223 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2242  nitrate reductase, beta subunit  54.89 
 
 		 517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0484783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3076  nitrate reductase, beta subunit  54.89 
 
 		 517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2626  nitrate reductase, beta subunit  55.09 
 
 		 517 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2682  nitrate reductase, beta subunit  55.09 
 
 		 517 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2258  nitrate reductase, beta subunit  56.01 
 
 		 521 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1515  nitrate reductase, beta subunit  54.89 
 
 		 517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2063  respiratory nitrate reductase beta subunit  56.85 
 
 		 514 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2314  respiratory nitrate reductase beta subunit  56.85 
 
 		 511 aa  584  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2882  nitrate reductase, beta subunit  56.82 
 
 		 514 aa  581  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2563  nitrate reductase, beta subunit  55.96 
 
 		 526 aa  579  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.219969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5683  nitrate reductase, beta subunit  55.21 
 
 		 509 aa  578  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1110  nitrate reductase, beta subunit  53.77 
 
 		 513 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2075  respiratory nitrate reductase subunit beta  53.06 
 
 		 517 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2227  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.11 
 
 		 512 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.414586  normal  0.0461834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2303  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.11 
 
 		 512 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.932469  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3865  nitrate reductase, beta subunit  55.62 
 
 		 507 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2705  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.47 
 
 		 508 aa  580  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.59941  normal  0.077732 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1914  nitrate reductase 1, beta subunit  56.33 
 
 		 512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.288869  normal  0.118614 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01203  nitrate reductase 1, beta (Fe-S) subunit  56.12 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.714292  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2420  nitrate reductase, beta subunit  56.33 
 
 		 512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0556426  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1377  nitrate reductase 1, beta subunit  56.03 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1709  nitrate reductase 1, beta subunit  56.12 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0253644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2235  nitrate reductase, beta subunit  55.6 
 
 		 514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1958  nitrate reductase 1 subunit beta  56.03 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1899  nitrate reductase 1, beta subunit  56.03 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.404395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2398  nitrate reductase, beta subunit  56.12 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2519  nitrate reductase, beta subunit  53.79 
 
 		 508 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  0.84462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01213  hypothetical protein  56.12 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.552443  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1894  nitrate reductase 1, beta subunit  56.03 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.256537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>