More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4477 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2804  nitrate reductase, beta subunit  63.89 
 
 		 558 aa  697    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.477441  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11187  respiratory nitrate reductase beta subunit narH  64.26 
 
 		 558 aa  699    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4477  nitrate reductase, beta subunit  100 
 
 		 526 aa  1091    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.619422  normal  0.432155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3700  nitrate reductase, beta subunit  67.74 
 
 		 554 aa  738    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3139  nitrate reductase, beta subunit  64.22 
 
 		 576 aa  695    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250265  hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5212  nitrate reductase subunit beta  67.42 
 
 		 560 aa  704    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  0.717062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1262  respiratory nitrate reductase beta subunit  65.97 
 
 		 551 aa  691    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5442  nitrate reductase (beta subunit)  66.85 
 
 		 553 aa  715    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18710  respiratory nitrate reductase beta subunit  66.88 
 
 		 544 aa  685    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0498038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0315  respiratory nitrate reductase beta subunit  66.92 
 
 		 557 aa  718    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0508  respiratory nitrate reductase beta subunit  63.19 
 
 		 549 aa  642    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.408187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1347  respiratory nitrate reductase beta subunit  66.29 
 
 		 584 aa  733    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1279  respiratory nitrate reductase beta subunit  65.97 
 
 		 551 aa  691    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.319698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4545  nitrate reductase, beta subunit  65.73 
 
 		 550 aa  698    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2039  nitrate reductase, beta subunit  63.11 
 
 		 511 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3674  nitrate reductase, beta subunit  66.23 
 
 		 561 aa  702    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00364422  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1236  nitrate reductase, beta subunit  62.01 
 
 		 507 aa  649    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.222412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1762  nitrate reductase, beta subunit  65.35 
 
 		 566 aa  704    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00378807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1288  nitrate reductase, beta subunit  65.97 
 
 		 551 aa  690    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2157  nitrate reductase, beta subunit  66.85 
 
 		 550 aa  732    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0178  nitrate reductase, beta subunit  63.56 
 
 		 539 aa  648    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4428  nitrate reductase, beta subunit  66.6 
 
 		 588 aa  731    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1825  nitrate reductase, beta subunit  64.31 
 
 		 559 aa  711    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1923  nitrate reductase (beta subunit)  70.13 
 
 		 543 aa  776    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0901  nitrate reductase, beta subunit  66.23 
 
 		 561 aa  701    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0193  nitrate reductase, beta subunit  63.98 
 
 		 539 aa  633  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0137302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1490  nitrate reductase, beta subunit  60.29 
 
 		 519 aa  613  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1206  respiratory nitrate reductase beta subunit  60.82 
 
 		 538 aa  609  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1955  respiratory nitrate reductase, beta subunit  57.82 
 
 		 491 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1933  respiratory nitrate reductase, beta subunit  57.82 
 
 		 491 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.287323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1972  nitrate reductase, beta subunit  57.6 
 
 		 491 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.991087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1978  respiratory nitrate reductase subunit beta  57.39 
 
 		 491 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4670  nitrate reductase, beta subunit  56.89 
 
 		 514 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5003  respiratory nitrate reductase beta subunit  54.14 
 
 		 515 aa  598  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248007  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3593  nitrate reductase, beta subunit  56.89 
 
 		 514 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.177223 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3400  nitrate reductase, beta subunit  57.39 
 
 		 491 aa  597  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1732  nitrate reductase, beta subunit  55.94 
 
 		 517 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2758  nitrate reductase, beta subunit  56.14 
 
 		 517 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1250  nitrate reductase, beta subunit  55.32 
 
 		 509 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2075  respiratory nitrate reductase subunit beta  53.67 
 
 		 517 aa  591  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2242  nitrate reductase, beta subunit  55.94 
 
 		 517 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0484783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3076  nitrate reductase, beta subunit  55.94 
 
 		 517 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2626  nitrate reductase, beta subunit  56.14 
 
 		 517 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2682  nitrate reductase, beta subunit  56.14 
 
 		 517 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1515  nitrate reductase, beta subunit  55.94 
 
 		 517 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2468  nitrate reductase, beta subunit  53.82 
 
 		 519 aa  586  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1853  nitrate reductase, beta subunit  55.53 
 
 		 517 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2519  nitrate reductase, beta subunit  55.17 
 
 		 508 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  0.84462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2636  nitrate reductase, beta subunit  58.28 
 
 		 489 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2420  nitrate reductase, beta subunit  53.82 
 
 		 519 aa  586  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1986  respiratory nitrate reductase, beta subunit  57.23 
 
 		 517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0975  respiratory nitrate reductase oxidoreductase protein  55.33 
 
 		 515 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0121  nitrate reductase, beta subunit  54.44 
 
 		 509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2793  nitrate reductase, beta subunit  56.01 
 
 		 507 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4594  respiratory nitrate reductase beta subunit  54 
 
 		 510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0662  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.53 
 
 		 507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.21299  normal  0.287133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3760  nitrate reductase, beta subunit  54 
 
 		 510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.281422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1629  nitrate reductase, beta subunit  54.44 
 
 		 509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1544  nitrate reductase, beta subunit  54.44 
 
 		 509 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0428  nitrate reductase, beta subunit  56.21 
 
 		 507 aa  578  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.090133  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5384  nitrate reductase, beta subunit  53.74 
 
 		 511 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302612  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0667  nitrate reductase, beta subunit  56.25 
 
 		 512 aa  580  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2591  nitrate reductase, beta subunit  56.1 
 
 		 509 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6463  nitrate reductase, beta subunit  53.74 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1002  respiratory nitrate reductase beta subunit  53.73 
 
 		 527 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5710  nitrate reductase, beta subunit  53.36 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0437  respiratory nitrate reductase beta subunit  56.21 
 
 		 507 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0538175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1707  respiratory nitrate reductase beta subunit  54 
 
 		 510 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5683  nitrate reductase, beta subunit  55.89 
 
 		 509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0606  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.24 
 
 		 512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2235  nitrate reductase, beta subunit  56.42 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1404  respiratory nitrate reductase beta subunit  52.16 
 
 		 522 aa  568  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314304  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3865  nitrate reductase, beta subunit  53.73 
 
 		 507 aa  570  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2705  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.25 
 
 		 508 aa  570  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.59941  normal  0.077732 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4235  nitrate reductase, beta subunit  55.58 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.312126  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1110  nitrate reductase, beta subunit  54.58 
 
 		 513 aa  568  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01425  nitrate reductase 2 (NRZ), beta subunit  53.19 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1648  nitrate reductase, beta subunit  53.19 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1551  nitrate reductase, beta subunit  53.48 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01437  hypothetical protein  53.19 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13800  respiratory nitrate reductase beta subuni  54.71 
 
 		 513 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6185  nitrate reductase, beta subunit  53.15 
 
 		 507 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.950636  normal  0.0269219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1235  nitrate reductase subunit beta  54.71 
 
 		 513 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2258  nitrate reductase, beta subunit  54.33 
 
 		 521 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2882  nitrate reductase, beta subunit  53.82 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2189  nitrate reductase, beta subunit  53.48 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1509  nitrate reductase, beta subunit  55.62 
 
 		 504 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2180  nitrate reductase, beta subunit  53.48 
 
 		 514 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1854  nitrate reductase, beta subunit  54.22 
 
 		 520 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0298  respiratory nitrate reductase, beta subunit  54.18 
 
 		 512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.609381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1958  nitrate reductase 1 subunit beta  53.78 
 
 		 511 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1756  nitrate reductase 2 subunit beta  52.42 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1583  nitrate reductase 2, beta subunit  52.42 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1560  nitrate reductase 1 subunit beta  53.88 
 
 		 512 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.713297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1695  nitrate reductase 2, beta subunit  52.62 
 
 		 514 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.401528 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1764  nitrate reductase 2 subunit beta  52.42 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.939627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1582  nitrate reductase, beta subunit  54.03 
 
 		 508 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000310576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1377  nitrate reductase 1, beta subunit  54.23 
 
 		 511 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2892  nitrate reductase, beta subunit  54.38 
 
 		 512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161802  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1707  nitrate reductase 2, beta subunit  53.48 
 
 		 514 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.764488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>