More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5212 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2039  nitrate reductase, beta subunit  65 
 
 
511 aa  666    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1955  respiratory nitrate reductase, beta subunit  58.73 
 
 
491 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1933  respiratory nitrate reductase, beta subunit  58.73 
 
 
491 aa  637    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.287323  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1762  nitrate reductase, beta subunit  71.17 
 
 
566 aa  784    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00378807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0193  nitrate reductase, beta subunit  60.23 
 
 
539 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0137302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3700  nitrate reductase, beta subunit  69.37 
 
 
554 aa  808    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5442  nitrate reductase (beta subunit)  72.55 
 
 
553 aa  796    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18710  respiratory nitrate reductase beta subunit  64.65 
 
 
544 aa  738    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0498038  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1825  nitrate reductase, beta subunit  67.99 
 
 
559 aa  779    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41544  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0901  nitrate reductase, beta subunit  70.58 
 
 
561 aa  802    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1923  nitrate reductase (beta subunit)  74.27 
 
 
543 aa  862    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1262  respiratory nitrate reductase beta subunit  71.79 
 
 
551 aa  795    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4477  nitrate reductase, beta subunit  67.8 
 
 
526 aa  736    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.619422  normal  0.432155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0315  respiratory nitrate reductase beta subunit  71.2 
 
 
557 aa  805    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0508  respiratory nitrate reductase beta subunit  62.25 
 
 
549 aa  681    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.408187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1347  respiratory nitrate reductase beta subunit  66.91 
 
 
584 aa  779    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5212  nitrate reductase subunit beta  100 
 
 
560 aa  1155    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  0.717062 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1279  respiratory nitrate reductase beta subunit  71.79 
 
 
551 aa  795    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.319698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4545  nitrate reductase, beta subunit  71.85 
 
 
550 aa  807    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3674  nitrate reductase, beta subunit  70.4 
 
 
561 aa  801    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00364422  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1236  nitrate reductase, beta subunit  62.96 
 
 
507 aa  686    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.222412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2804  nitrate reductase, beta subunit  70.32 
 
 
558 aa  786    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.477441  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1288  nitrate reductase, beta subunit  71.77 
 
 
551 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4428  nitrate reductase, beta subunit  79.64 
 
 
588 aa  906    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283644  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2157  nitrate reductase, beta subunit  71.98 
 
 
550 aa  824    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0178  nitrate reductase, beta subunit  59.47 
 
 
539 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1972  nitrate reductase, beta subunit  58.93 
 
 
491 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.991087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3139  nitrate reductase, beta subunit  68.93 
 
 
576 aa  761    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250265  hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1490  nitrate reductase, beta subunit  62.38 
 
 
519 aa  665    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11187  respiratory nitrate reductase beta subunit narH  68.13 
 
 
558 aa  790    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1978  respiratory nitrate reductase subunit beta  58.73 
 
 
491 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2636  nitrate reductase, beta subunit  59.59 
 
 
489 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3400  nitrate reductase, beta subunit  58.73 
 
 
491 aa  630  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1986  respiratory nitrate reductase, beta subunit  60.26 
 
 
517 aa  617  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1206  respiratory nitrate reductase beta subunit  60.58 
 
 
538 aa  617  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2468  nitrate reductase, beta subunit  59.91 
 
 
519 aa  606  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2420  nitrate reductase, beta subunit  59.91 
 
 
519 aa  606  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2075  respiratory nitrate reductase subunit beta  55.47 
 
 
517 aa  594  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2591  nitrate reductase, beta subunit  55.36 
 
 
509 aa  591  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5003  respiratory nitrate reductase beta subunit  53.97 
 
 
515 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1509  nitrate reductase, beta subunit  56.21 
 
 
504 aa  589  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2758  nitrate reductase, beta subunit  56.01 
 
 
517 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1235  nitrate reductase subunit beta  54.98 
 
 
513 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484978  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1853  nitrate reductase, beta subunit  55.8 
 
 
517 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3593  nitrate reductase, beta subunit  56.59 
 
 
514 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.177223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4670  nitrate reductase, beta subunit  56.59 
 
 
514 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13800  respiratory nitrate reductase beta subuni  54.98 
 
 
513 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2626  nitrate reductase, beta subunit  56.01 
 
 
517 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2682  nitrate reductase, beta subunit  56.01 
 
 
517 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1582  nitrate reductase, beta subunit  55.1 
 
 
508 aa  589  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000310576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5683  nitrate reductase, beta subunit  55.56 
 
 
509 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192877  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0975  respiratory nitrate reductase oxidoreductase protein  55.98 
 
 
515 aa  587  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1732  nitrate reductase, beta subunit  55.8 
 
 
517 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4594  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.44 
 
 
510 aa  585  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0662  respiratory nitrate reductase beta subunit  56.62 
 
 
507 aa  587  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.21299  normal  0.287133 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2242  nitrate reductase, beta subunit  55.8 
 
 
517 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0484783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3076  nitrate reductase, beta subunit  55.8 
 
 
517 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1515  nitrate reductase, beta subunit  55.8 
 
 
517 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0667  nitrate reductase, beta subunit  55.42 
 
 
512 aa  586  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.812713  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2705  respiratory nitrate reductase beta subunit  54.97 
 
 
508 aa  582  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.59941  normal  0.077732 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2519  nitrate reductase, beta subunit  56.3 
 
 
508 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  0.84462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0428  nitrate reductase, beta subunit  54.99 
 
 
507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.090133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3760  nitrate reductase, beta subunit  54.19 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.281422  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0437  respiratory nitrate reductase beta subunit  54.99 
 
 
507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0538175  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2235  nitrate reductase, beta subunit  56.29 
 
 
514 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1110  nitrate reductase, beta subunit  53.83 
 
 
513 aa  581  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0606  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.02 
 
 
512 aa  580  1e-164  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2258  nitrate reductase, beta subunit  55.85 
 
 
521 aa  581  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1250  nitrate reductase, beta subunit  55.18 
 
 
509 aa  579  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2563  nitrate reductase, beta subunit  55.89 
 
 
526 aa  578  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.219969  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6463  nitrate reductase, beta subunit  55.49 
 
 
511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2793  nitrate reductase, beta subunit  54.58 
 
 
507 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016415  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5710  nitrate reductase, beta subunit  55.28 
 
 
511 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2063  respiratory nitrate reductase beta subunit  56.82 
 
 
514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6185  nitrate reductase, beta subunit  55.6 
 
 
507 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.950636  normal  0.0269219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2633  nitrate reductase, beta subunit  53.86 
 
 
512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.56399  normal  0.025961 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1894  nitrate reductase 1, beta subunit  55.28 
 
 
511 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.256537 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0298  respiratory nitrate reductase, beta subunit  54.14 
 
 
512 aa  571  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.609381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1899  nitrate reductase 1, beta subunit  55.28 
 
 
511 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.404395  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0121  nitrate reductase, beta subunit  54.99 
 
 
509 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1377  nitrate reductase 1, beta subunit  55.28 
 
 
511 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3865  nitrate reductase, beta subunit  53.65 
 
 
507 aa  573  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3179  respiratory nitrate reductase, beta subunit  57.33 
 
 
453 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5384  nitrate reductase, beta subunit  54.67 
 
 
511 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302612  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1629  nitrate reductase, beta subunit  54.99 
 
 
509 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1544  nitrate reductase, beta subunit  54.99 
 
 
509 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2276  respiratory nitrate reductase, beta subunit  57.33 
 
 
453 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.434638  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2314  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.89 
 
 
511 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01425  nitrate reductase 2 (NRZ), beta subunit  55.4 
 
 
514 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2180  nitrate reductase, beta subunit  55.6 
 
 
514 aa  570  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109397  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2420  nitrate reductase, beta subunit  55.78 
 
 
512 aa  570  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0556426  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1551  nitrate reductase, beta subunit  55.4 
 
 
514 aa  569  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1764  nitrate reductase 2 subunit beta  54.97 
 
 
514 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.939627  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1560  nitrate reductase 1 subunit beta  55.38 
 
 
512 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.713297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2127  nitrate reductase, beta subunit  56.12 
 
 
509 aa  571  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2159  respiratory nitrate reductase, beta subunit  57.11 
 
 
453 aa  571  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1002  respiratory nitrate reductase beta subunit  53.92 
 
 
527 aa  571  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33657  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2136  respiratory nitrate reductase, beta subunit  57.11 
 
 
453 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1376  nitrate reductase, beta subunit  55.58 
 
 
512 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0922315  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0274  nitrate reductase, beta subunit  54.14 
 
 
512 aa  568  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>