More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1764 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1376  nitrate reductase, beta subunit  79.64 
 
 		 512 aa  870    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0922315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01203  nitrate reductase 1, beta (Fe-S) subunit  79.84 
 
 		 512 aa  874    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.714292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01425  nitrate reductase 2 (NRZ), beta subunit  94.36 
 
 		 514 aa  1030    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2398  nitrate reductase, beta subunit  79.84 
 
 		 512 aa  874    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3865  nitrate reductase, beta subunit  71.23 
 
 		 507 aa  790    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2180  nitrate reductase, beta subunit  94.55 
 
 		 514 aa  1031    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109397  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2420  nitrate reductase, beta subunit  80.04 
 
 		 512 aa  875    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0556426  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1955  respiratory nitrate reductase beta subuni  72.64 
 
 		 512 aa  812    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.089713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2314  respiratory nitrate reductase beta subunit  79.8 
 
 		 511 aa  880    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5683  nitrate reductase, beta subunit  70.74 
 
 		 509 aa  772    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0975  respiratory nitrate reductase oxidoreductase protein  68.51 
 
 		 515 aa  776    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0298  respiratory nitrate reductase, beta subunit  71.49 
 
 		 512 aa  788    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.609381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1978  respiratory nitrate reductase subunit beta  59.5 
 
 		 491 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1955  respiratory nitrate reductase, beta subunit  59.92 
 
 		 491 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1933  respiratory nitrate reductase, beta subunit  59.92 
 
 		 491 aa  645    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.287323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1732  nitrate reductase, beta subunit  65.96 
 
 		 517 aa  765    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1235  nitrate reductase subunit beta  73.35 
 
 		 513 aa  822    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484978  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0606  respiratory nitrate reductase beta subunit  73.67 
 
 		 512 aa  805    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03846  nitrate reductase, beta subunit  68.95 
 
 		 437 aa  662    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5003  respiratory nitrate reductase beta subunit  69.52 
 
 		 515 aa  779    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1551  nitrate reductase, beta subunit  94.16 
 
 		 514 aa  1028    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1404  respiratory nitrate reductase beta subunit  63.98 
 
 		 522 aa  712    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314304  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1693  nitrate reductase 2, beta subunit  99.81 
 
 		 514 aa  1078    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.595471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1764  nitrate reductase 2 subunit beta  100 
 
 		 514 aa  1080    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.939627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1377  nitrate reductase 1, beta subunit  81.39 
 
 		 511 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2758  nitrate reductase, beta subunit  66.15 
 
 		 517 aa  767    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0121  nitrate reductase, beta subunit  71.66 
 
 		 509 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1648  nitrate reductase, beta subunit  94.55 
 
 		 514 aa  1031    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1582  nitrate reductase, beta subunit  68.75 
 
 		 508 aa  746    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000310576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2882  nitrate reductase, beta subunit  78.71 
 
 		 514 aa  890    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1695  nitrate reductase 2, beta subunit  99.42 
 
 		 514 aa  1075    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.401528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1958  nitrate reductase 1 subunit beta  81.19 
 
 		 511 aa  900    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1110  nitrate reductase, beta subunit  70.59 
 
 		 513 aa  774    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01213  hypothetical protein  79.84 
 
 		 512 aa  874    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.552443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1335  nitrate reductase, beta subunit  79.84 
 
 		 512 aa  873    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00571547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1894  nitrate reductase 1, beta subunit  81.39 
 
 		 511 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.256537 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1250  nitrate reductase, beta subunit  70.47 
 
 		 509 aa  785    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1853  nitrate reductase, beta subunit  66.15 
 
 		 517 aa  766    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1899  nitrate reductase 1, beta subunit  81.58 
 
 		 511 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.404395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1756  nitrate reductase 2 subunit beta  99.81 
 
 		 514 aa  1078    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2258  nitrate reductase, beta subunit  79.02 
 
 		 521 aa  883    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2793  nitrate reductase, beta subunit  71.83 
 
 		 507 aa  789    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4594  respiratory nitrate reductase beta subunit  71.4 
 
 		 510 aa  790    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1331  respiratory nitrate reductase beta subunit  75.9 
 
 		 519 aa  823    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1583  nitrate reductase 2, beta subunit  99.61 
 
 		 514 aa  1077    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1560  nitrate reductase 1 subunit beta  81.23 
 
 		 512 aa  898    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.713297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2075  respiratory nitrate reductase subunit beta  69.28 
 
 		 517 aa  783    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3593  nitrate reductase, beta subunit  69.5 
 
 		 514 aa  780    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.177223 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6185  nitrate reductase, beta subunit  72.02 
 
 		 507 aa  794    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.950636  normal  0.0269219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2633  nitrate reductase, beta subunit  72.44 
 
 		 512 aa  807    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.56399  normal  0.025961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2227  respiratory nitrate reductase beta subunit  77.27 
 
 		 512 aa  870    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.414586  normal  0.0461834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2303  respiratory nitrate reductase beta subunit  77.27 
 
 		 512 aa  870    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.932469  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2189  nitrate reductase, beta subunit  94.36 
 
 		 514 aa  1030    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1002  respiratory nitrate reductase beta subunit  71.49 
 
 		 527 aa  766    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5384  nitrate reductase, beta subunit  68.96 
 
 		 511 aa  779    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302612  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2705  respiratory nitrate reductase beta subunit  70.48 
 
 		 508 aa  771    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.59941  normal  0.077732 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5710  nitrate reductase, beta subunit  71.69 
 
 		 511 aa  790    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13800  respiratory nitrate reductase beta subuni  73.35 
 
 		 513 aa  822    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1772  nitrate reductase, beta subunit  76.83 
 
 		 520 aa  858    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2063  respiratory nitrate reductase beta subunit  92.61 
 
 		 514 aa  1010    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2591  nitrate reductase, beta subunit  71.14 
 
 		 509 aa  773    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2634  nitrate reductase, beta subunit  62.3 
 
 		 523 aa  696    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.832447  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4235  nitrate reductase, beta subunit  68.34 
 
 		 505 aa  747    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.312126  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2563  nitrate reductase, beta subunit  78.25 
 
 		 526 aa  877    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.219969  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0274  nitrate reductase, beta subunit  71.29 
 
 		 512 aa  782    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1509  nitrate reductase, beta subunit  71.49 
 
 		 504 aa  767    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0428  nitrate reductase, beta subunit  71.23 
 
 		 507 aa  781    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.090133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3085  nitrate reductase, beta subunit  75.6 
 
 		 525 aa  833    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0662  respiratory nitrate reductase beta subunit  71.03 
 
 		 507 aa  788    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.21299  normal  0.287133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3760  nitrate reductase, beta subunit  70.22 
 
 		 510 aa  781    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.281422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0437  respiratory nitrate reductase beta subunit  71.03 
 
 		 507 aa  780    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0538175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1707  nitrate reductase 2, beta subunit  94.55 
 
 		 514 aa  1031    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.764488 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2242  nitrate reductase, beta subunit  65.96 
 
 		 517 aa  765    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0484783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2235  nitrate reductase, beta subunit  72.89 
 
 		 514 aa  794    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0667  nitrate reductase, beta subunit  74.85 
 
 		 512 aa  817    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1707  respiratory nitrate reductase beta subunit  69.55 
 
 		 510 aa  768    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01437  hypothetical protein  94.36 
 
 		 514 aa  1030    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3076  nitrate reductase, beta subunit  65.96 
 
 		 517 aa  765    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688068  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1914  nitrate reductase 1, beta subunit  80.04 
 
 		 512 aa  875    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.288869  normal  0.118614 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4670  nitrate reductase, beta subunit  69.5 
 
 		 514 aa  780    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1709  nitrate reductase 1, beta subunit  79.84 
 
 		 512 aa  874    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0253644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2626  nitrate reductase, beta subunit  66.15 
 
 		 517 aa  767    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1629  nitrate reductase, beta subunit  71.66 
 
 		 509 aa  781    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2892  nitrate reductase, beta subunit  71.89 
 
 		 512 aa  789    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2682  nitrate reductase, beta subunit  66.15 
 
 		 517 aa  767    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1854  nitrate reductase, beta subunit  77.23 
 
 		 520 aa  870    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1544  nitrate reductase, beta subunit  71.46 
 
 		 509 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1393  nitrate reductase 1, beta subunit  79.64 
 
 		 512 aa  872    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6463  nitrate reductase, beta subunit  71.29 
 
 		 511 aa  789    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1515  nitrate reductase, beta subunit  65.96 
 
 		 517 aa  765    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1972  nitrate reductase, beta subunit  59.09 
 
 		 491 aa  639    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.991087  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2519  nitrate reductase, beta subunit  72.09 
 
 		 508 aa  793    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  0.84462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2077  nitrate reductase 2, beta subunit  94.36 
 
 		 514 aa  1031    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2127  nitrate reductase, beta subunit  70.14 
 
 		 509 aa  749    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3400  nitrate reductase, beta subunit  59.09 
 
 		 491 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1986  respiratory nitrate reductase, beta subunit  59.35 
 
 		 517 aa  630  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2420  nitrate reductase, beta subunit  58.7 
 
 		 519 aa  625  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2468  nitrate reductase, beta subunit  58.7 
 
 		 519 aa  625  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2636  nitrate reductase, beta subunit  58.68 
 
 		 489 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1206  respiratory nitrate reductase beta subunit  57.47 
 
 		 538 aa  609  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>