54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1900 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1900  TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system small permease component-like  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231956  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2342  hypothetical protein  58.53 
 
 		 317 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.488163  normal  0.194568 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0879  TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system small permease component-like  55.56 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.214091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2881  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.62 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.901818  hitchhiker  0.000150044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2812  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.13 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3640  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.49 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.6832  normal  0.687836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3149  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.63 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0190342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3769  hypothetical protein  32.26 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2293  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.89 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0359  hypothetical protein  26.55 
 
 		 182 aa  53.1  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.537959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0672  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.43 
 
 		 179 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0343  hypothetical protein  26.55 
 
 		 182 aa  53.1  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2752  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  40.26 
 
 		 180 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.328918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0444  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.83 
 
 		 182 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4765  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.48 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0885  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.12 
 
 		 184 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000127189 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1205  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.33 
 
 		 161 aa  50.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0130  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  25.62 
 
 		 173 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2544  TRAP-type transport system, small permease component  23.53 
 
 		 168 aa  49.7  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1403  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  28.33 
 
 		 174 aa  49.7  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2019  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.48 
 
 		 179 aa  49.3  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126943  normal  0.0153183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0694  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  40.26 
 
 		 180 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617853  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1202  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  39.39 
 
 		 183 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00964001  normal  0.857795 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1506  triosephosphate isomerase (TIM; Triose-phosphateisomerase)  25.89 
 
 		 169 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1553  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  38.89 
 
 		 200 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2649  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.94 
 
 		 184 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0453  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.62 
 
 		 198 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0983838  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1415  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25 
 
 		 168 aa  47.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1622  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  34.78 
 
 		 184 aa  47.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3017  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.12 
 
 		 190 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4424  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.06 
 
 		 178 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3621  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.52 
 
 		 173 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.767464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1711  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.58 
 
 		 191 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0725939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2072  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.57 
 
 		 198 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1556  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  35.71 
 
 		 198 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0601  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.63 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0961  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  35.71 
 
 		 168 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.093725  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3371  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  24.12 
 
 		 190 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123148  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0654  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.36 
 
 		 183 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.197985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2006  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.47 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.404305  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1565  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.59 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.124017  normal  0.0201638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3474  putative TRAP C4-dicarboxylate transport system, DctQ subunit (small permease component)  33.33 
 
 		 179 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3868  hypothetical protein  22.66 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3372  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  37.93 
 
 		 179 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2882  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  37.74 
 
 		 204 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0770151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2246  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  45.24 
 
 		 202 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1688  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.75 
 
 		 199 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1814  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  19.51 
 
 		 185 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2051  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.36 
 
 		 197 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3061  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.21 
 
 		 186 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287187  hitchhiker  0.000081525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1218  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  35.38 
 
 		 179 aa  43.1  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3390  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.43 
 
 		 201 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2190  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.43 
 
 		 198 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1476  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.92 
 
 		 179 aa  42.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.661481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>