More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1580 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1496  L-aspartate oxidase  67.84 
 
 
550 aa  645    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.750119  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1580  L-aspartate oxidase  100 
 
 
623 aa  1229    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.76 
 
 
531 aa  577  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0529  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.23 
 
 
532 aa  572  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1003  L-aspartate oxidase  41.99 
 
 
534 aa  324  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0437  L-aspartate oxidase  42.5 
 
 
534 aa  319  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  43.79 
 
 
533 aa  317  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  40.69 
 
 
531 aa  312  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0806  L-aspartate oxidase  40.38 
 
 
541 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 
531 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1351  L-aspartate oxidase  40.12 
 
 
528 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.35363  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  42.65 
 
 
533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 
540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  41.13 
 
 
534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  39.49 
 
 
531 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  42.25 
 
 
528 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 
540 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  39.06 
 
 
531 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  42.32 
 
 
560 aa  303  6.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1829  L-aspartate oxidase  41.34 
 
 
534 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0426262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  41.06 
 
 
540 aa  302  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  42.21 
 
 
534 aa  301  2e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  42.04 
 
 
533 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  40.95 
 
 
535 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  39.53 
 
 
537 aa  301  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 
531 aa  301  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  41.84 
 
 
533 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  40.8 
 
 
534 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  40.61 
 
 
539 aa  300  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  40.87 
 
 
543 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4734  L-aspartate oxidase  38.05 
 
 
526 aa  300  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.734093  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  40.85 
 
 
540 aa  300  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  40.85 
 
 
540 aa  300  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  40.85 
 
 
540 aa  300  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0526  L-aspartate oxidase  39.37 
 
 
530 aa  300  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.761934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  40.87 
 
 
538 aa  300  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  40.85 
 
 
540 aa  300  7e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  40.85 
 
 
530 aa  300  7e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  37.96 
 
 
542 aa  297  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  38.72 
 
 
531 aa  296  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  39.53 
 
 
532 aa  296  6e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  40.5 
 
 
538 aa  296  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  40.45 
 
 
540 aa  296  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  40.24 
 
 
539 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  41.63 
 
 
538 aa  296  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  41.63 
 
 
538 aa  296  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  40.36 
 
 
534 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  40.62 
 
 
538 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  40.52 
 
 
540 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  40.36 
 
 
534 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  40.61 
 
 
522 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  40.52 
 
 
540 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  40.42 
 
 
538 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  40.52 
 
 
540 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  39.6 
 
 
533 aa  294  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0686  L-aspartate oxidase  38.74 
 
 
527 aa  294  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.28562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  43.25 
 
 
535 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  39.8 
 
 
533 aa  294  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  39.4 
 
 
533 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  39.4 
 
 
533 aa  293  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  39.4 
 
 
545 aa  293  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  40.46 
 
 
538 aa  293  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  41.15 
 
 
537 aa  293  8e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  41.02 
 
 
525 aa  292  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  40.57 
 
 
539 aa  292  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  40.89 
 
 
537 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  40.04 
 
 
534 aa  292  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  40.04 
 
 
536 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1373  L-aspartate oxidase  39.53 
 
 
527 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.588403  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2315  L-aspartate oxidase  41.63 
 
 
528 aa  291  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  41.01 
 
 
535 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  40.7 
 
 
537 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0330  L-aspartate oxidase  38.4 
 
 
511 aa  290  5.0000000000000004e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  35.91 
 
 
532 aa  290  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  38.72 
 
 
532 aa  290  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  42.05 
 
 
537 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  41.38 
 
 
537 aa  289  9e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  42.05 
 
 
537 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  41.38 
 
 
537 aa  289  9e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  42.05 
 
 
537 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  39.31 
 
 
533 aa  289  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0410  L-aspartate oxidase  43.08 
 
 
532 aa  289  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.632554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  42.05 
 
 
537 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  42.77 
 
 
532 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  40.76 
 
 
535 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  40.91 
 
 
538 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  37.72 
 
 
543 aa  288  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  38.62 
 
 
528 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  40 
 
 
537 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  40.56 
 
 
535 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  40.45 
 
 
535 aa  287  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  39.51 
 
 
550 aa  286  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  42.57 
 
 
541 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  42.59 
 
 
532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  43.32 
 
 
570 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5132  L-aspartate oxidase  37.55 
 
 
528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.792013 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  43.32 
 
 
570 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  43.32 
 
 
570 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  40.12 
 
 
545 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  43.32 
 
 
570 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>