181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2960 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2960  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
389 aa  808    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1946  transposase, IS605 OrfB family  45.23 
 
 
418 aa  253  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.501136  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2646  transposase, IS605 OrfB family  52.42 
 
 
418 aa  253  5.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.866499  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3228  transposase, IS605 OrfB family  49.4 
 
 
419 aa  246  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1128  transposase, IS605 OrfB family  49.4 
 
 
419 aa  246  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1239  transposase, IS605 OrfB family  44.93 
 
 
409 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3366  transposase, IS605 OrfB family  42.28 
 
 
411 aa  179  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2928  transposase, IS605 OrfB family  42.28 
 
 
411 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4104  transposase, IS605 OrfB family  42.04 
 
 
419 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3186  transposase, IS605 OrfB family  39.71 
 
 
440 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1885  transposase, IS605 OrfB family  39.71 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4086  transposase, IS605 OrfB family  41.77 
 
 
394 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4123  transposase, IS605 OrfB family  31.31 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2491  transposase, IS605 OrfB family  33.82 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3810  transposase, IS605 OrfB family  32.64 
 
 
445 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3980  transposase, IS605 OrfB family  27.97 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0680  transposase, IS605 OrfB  32.21 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0877  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000122455  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2741  transposase, IS605 OrfB  32.21 
 
 
518 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230719  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3034  transposase, IS605 OrfB family  28.89 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3343  transposase, IS605 OrfB family  29.54 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2840  transposase, IS605 OrfB family  30.34 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2374  transposase, IS605 OrfB family  31.25 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2549  transposase, IS605 OrfB family  30.26 
 
 
400 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0569  transposase, IS605 OrfB family  31.28 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.853374 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1982  transposase, IS605 OrfB family  30.84 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2685  transposase, IS605 OrfB family  29.44 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0861  transposase, IS1341 family  28.44 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3375  transposase, IS605 OrfB family  29.18 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2065  transposase, IS1341 family  40.71 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1635  transposase, IS605 OrfB family  31.28 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2211  transposase IS605  32.45 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0534  transposase, IS605 OrfB family  32.14 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.268314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2350  IS605 family transposase OrfB  33.15 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6879  IS605 family transposase OrfB  44 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0928  transposase, IS605 OrfB  30.17 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.621318  normal  0.596351 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1199  transposase IS605  32.16 
 
 
410 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0968514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4668  transposase  26.99 
 
 
359 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2561  transposase, IS605 OrfB family  29.15 
 
 
440 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467488  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2621  transposase, IS605 OrfB family  27.97 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1086  transposase, IS605 OrfB family  35.94 
 
 
434 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2902  transposase  32.16 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00617488  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0996  transposase, IS605 OrfB family  29.6 
 
 
409 aa  63.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4205  transposase, IS605 OrfB family  31.65 
 
 
417 aa  63.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0541  transposase, IS605 OrfB family  31.72 
 
 
372 aa  63.2  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1480  IS605 family transposase OrfB  27.83 
 
 
362 aa  63.2  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0882  transposase  27.8 
 
 
359 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00721916  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3043  IS605 family transposase OrfB  28.51 
 
 
450 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4128  transposase, IS605 OrfB family  28.11 
 
 
397 aa  60.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.431566  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2881  transposase, IS605 OrfB family  31.47 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1230  transposase  44.44 
 
 
462 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138026  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1833  IS605 family transposase OrfB  38.61 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7429  transposase  39 
 
 
358 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1656  IS605 family transposase OrfB  32.03 
 
 
251 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0298129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2198  transposase IS605  34.15 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2125  transposase, IS605 OrfB family  43.59 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00617237  decreased coverage  0.0000396034 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3159  transposase, IS605 OrfB family  28.02 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2016  transposase  38.38 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1161  transposase, IS605 OrfB family  29.44 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1250  transposase, IS605 OrfB family  28.48 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1528  transposase, IS605 OrfB family  24.58 
 
 
402 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3901  transposase, IS605 OrfB family  24.58 
 
 
402 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0136  transposase, IS605 OrfB family  36.97 
 
 
415 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3626  transposase, IS605 OrfB family  31.11 
 
 
425 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4673  transpoase  28.27 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5275  transposase, family IS1341  29.41 
 
 
463 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0827371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1692  transposase  37 
 
 
358 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153302  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5480  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
419 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.92096 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1603  transposase, IS605 OrfB family  26.97 
 
 
426 aa  53.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0811903 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0800  transposase  37.37 
 
 
373 aa  53.1  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2488  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
439 aa  53.1  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2493  transposase, IS605 OrfB family  31.87 
 
 
401 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0563  transposase, IS605 OrfB family  27.85 
 
 
372 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3330  Transport-associated OB domain protein  25.31 
 
 
418 aa  53.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133521  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2941  transposase, IS605 OrfB family  31.87 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0216  hypothetical protein  37.11 
 
 
134 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5354  transposase, family IS1341  29.41 
 
 
442 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3912  transposase, IS605 OrfB family  38.37 
 
 
422 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.108005  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0681  transposase, IS605 OrfB family  35.45 
 
 
427 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146428  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1328  transposase, IS605 OrfB family protein, putative  34.11 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0563  transposase, IS605 OrfB family  31.71 
 
 
375 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.11437 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3539  transposase, IS605 OrfB family  31.71 
 
 
375 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.3879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1753  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1851  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000015791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0410  transposase, IS605 OrfB family  26.9 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0124174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2261  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1061  IS605 family transposase OrfB  32.67 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00139779  hitchhiker  0.000000305099 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2867  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2682  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0586461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2654  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00128227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0585  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0615  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.562099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1167  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000668854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1257  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1446  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.252161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1577  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0208104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1586  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000279316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1604  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1768  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
360 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>