70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1328 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1328  transposase, IS605 OrfB family protein, putative  100 
 
 
439 aa  907    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0750  IS605 family transposase OrfB  46.33 
 
 
410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0713  IS605 family transposase OrfB  29.09 
 
 
460 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0154  transposase, IS605 OrfB family  27.71 
 
 
438 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.732163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2374  transposase, IS605 OrfB family  32.72 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3186  transposase, IS605 OrfB family  29.85 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3343  transposase, IS605 OrfB family  32.72 
 
 
351 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1885  transposase, IS605 OrfB family  29.85 
 
 
440 aa  64.7  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1982  transposase, IS605 OrfB family  32.26 
 
 
351 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2549  transposase, IS605 OrfB family  31.34 
 
 
400 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2840  transposase, IS605 OrfB family  31.34 
 
 
351 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3228  transposase, IS605 OrfB family  25.8 
 
 
419 aa  61.6  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1128  transposase, IS605 OrfB family  25.8 
 
 
419 aa  61.6  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0996  transposase, IS605 OrfB family  27.9 
 
 
409 aa  61.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4668  transposase  30.99 
 
 
359 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4786  IS605 family transposase OrfB  30.41 
 
 
359 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2685  transposase, IS605 OrfB family  30.88 
 
 
351 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1635  transposase, IS605 OrfB family  30.37 
 
 
351 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4104  transposase, IS605 OrfB family  27.36 
 
 
419 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2646  transposase, IS605 OrfB family  28.57 
 
 
418 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.866499  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0882  transposase  29.24 
 
 
359 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00721916  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3366  transposase, IS605 OrfB family  27.09 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4673  transpoase  28.07 
 
 
359 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2928  transposase, IS605 OrfB family  27.09 
 
 
411 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1714  transposase IS605 OrfB  24.92 
 
 
531 aa  54.3  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3293  transposase, IS605 OrfB family  32.54 
 
 
405 aa  53.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.944265  normal  0.342145 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0534  transposase, IS605 OrfB family  28.14 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.268314  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4205  transposase, IS605 OrfB family  28.63 
 
 
417 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1833  IS605 family transposase OrfB  29.9 
 
 
368 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4086  transposase, IS605 OrfB family  32.03 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0541  transposase, IS605 OrfB family  30.1 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2960  transposase, IS605 OrfB family  34.11 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1671  transposase, IS605 OrfB family  31.75 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0991  IS605 family transposase OrfB  22.57 
 
 
402 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0485  transposase IS605 OrfB  24.74 
 
 
530 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0995557  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1086  transposase, IS605 OrfB family  28.16 
 
 
434 aa  51.2  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1404  transposase IS605 OrfB  24.58 
 
 
530 aa  50.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1161  transposase, IS605 OrfB family  30.1 
 
 
372 aa  50.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0680  transposase, IS605 OrfB  25.82 
 
 
414 aa  50.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0819  transposase IS605 OrfB  25.46 
 
 
530 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.330178  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1156  IS605 family transposase OrfB  22.22 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0034474  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2195  transposase, IS605 OrfB family  24.55 
 
 
590 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1946  transposase, IS605 OrfB family  26.61 
 
 
418 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.501136  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1115  IS605 family transposase OrfB  21.4 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1912  transposase, IS605 OrfB family  24.55 
 
 
590 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0877  IS605 family transposase OrfB  26.98 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000122455  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0573  IS605 family transposase OrfB  22.22 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1239  transposase, IS605 OrfB family  24.51 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3159  transposase, IS605 OrfB family  22.81 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2741  transposase, IS605 OrfB  32.2 
 
 
518 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0973  IS605 family transposase OrfB  21.4 
 
 
402 aa  48.5  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0236734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0150  IS605 family transposase OrfB  21.79 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.158442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0389  transposase IS605 OrfB  25.56 
 
 
530 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.408689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1817  transposase IS605 OrfB  23.73 
 
 
530 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1189  transposase, IS605 OrfB family  27.63 
 
 
382 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1577  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
396 aa  47  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.833624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0523  transposase IS605 OrfB  26.43 
 
 
497 aa  47  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.370544  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2491  transposase, IS605 OrfB family  30.4 
 
 
349 aa  47.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2211  transposase IS605  27.6 
 
 
371 aa  47  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2902  transposase  26.47 
 
 
407 aa  46.6  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00617488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1199  transposase IS605  29.08 
 
 
410 aa  47  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0968514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2286  IS605 family transposase OrfB  24.48 
 
 
399 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.989096  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0152  IS605 family transposase OrfB  21.4 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0917796  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1561  transposase, IS605 OrfB family  24.43 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.786289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0132  transposase IS605 OrfB  23.47 
 
 
530 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.178018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0123  transposase IS605 OrfB  23.47 
 
 
530 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2561  transposase, IS605 OrfB family  26.58 
 
 
440 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0800  transposase  27.98 
 
 
373 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3030  transposase, IS605 OrfB family  25.49 
 
 
396 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  32.34 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>