44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0395 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 93 aa  190  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  77.92 
 
 		 97 aa  123  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  78.48 
 
 		 90 aa  122  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  77.92 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  71.25 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  55.41 
 
 		 88 aa  87.4  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  54.17 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  58.82 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  59.42 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  62.5 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  60.29 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  59.38 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  46.99 
 
 		 366 aa  80.5  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  60.94 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  58.82 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  53.52 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  53.97 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  50.7 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  57.58 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  58.21 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  54.67 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  55.88 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  54.55 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.28 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  49.28 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  51.35 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  46.75 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  49.23 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  53.97 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  45.71 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  47.62 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  43.55 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1331  ATP-NAD/AcoX kinase  56.82 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.441471  normal  0.309814 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  50.82 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 293 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0973  hypothetical protein  38.24 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  36.36 
 
 		 326 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1623  hypothetical protein  33.73 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0247815 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0445  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1535  hypothetical protein  32.91 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.397165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>