40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2450 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  157  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  60.53 
 
 		 76 aa  102  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  65.67 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  54.55 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1623  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0247815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  46.97 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  45.07 
 
 		 78 aa  67  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  50.75 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  46.97 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1535  hypothetical protein  49.21 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.397165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  54.9 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 88 aa  57  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  38.81 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  43.55 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  41.79 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  41.79 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  43.55 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  40.91 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  39.68 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  41.27 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.71 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  38.81 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  40.32 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  45.31 
 
 		 332 aa  52  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  39.34 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  37.31 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  38.71 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 293 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  38.71 
 
 		 293 aa  47  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  34.85 
 
 		 326 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>