41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3617 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 94 aa  188  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  76.74 
 
 		 99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  58.57 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  55.71 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  47.67 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  57.14 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  54.29 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  51.43 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  55.71 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  56.34 
 
 		 93 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  52.63 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  52.78 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  50.65 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  43.75 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  54.69 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  48.48 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  48.48 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  45.59 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  42.65 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  41.54 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  35.06 
 
 		 332 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  39.68 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  38.57 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  45.9 
 
 		 293 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 293 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  37.1 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0973  hypothetical protein  35.82 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.346904 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0445  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  33.33 
 
 		 326 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1331  ATP-NAD/AcoX kinase  51.22 
 
 		 326 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.441471  normal  0.309814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  38.71 
 
 		 77 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>