42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1304 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  185  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  91.4 
 
 
93 aa  167  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  76.92 
 
 
92 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  76.92 
 
 
90 aa  130  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  70.97 
 
 
89 aa  130  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  60.44 
 
 
92 aa  100  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  66.22 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  66.18 
 
 
88 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
87 aa  92  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  62.32 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  64.71 
 
 
88 aa  90.1  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  61.76 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  57.89 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  56.34 
 
 
94 aa  80.1  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  53.75 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  55.71 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  52.63 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  57.35 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  53.52 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  59.09 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  57.58 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  56.25 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  51.56 
 
 
74 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  52.17 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  55.74 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  59.38 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  48.61 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  50.72 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  46.97 
 
 
332 aa  61.6  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  41.94 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 
366 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
105 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  39.34 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  51.85 
 
 
68 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1331  ATP-NAD/AcoX kinase  43.48 
 
 
326 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.441471  normal  0.309814 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  48.39 
 
 
293 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0973  hypothetical protein  42.03 
 
 
85 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  43.55 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
293 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  38.1 
 
 
326 aa  48.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0445  conserved hypothetical protein  40.98 
 
 
78 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>