42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2901 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
92 aa  185  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  71.76 
 
 
88 aa  124  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  76.25 
 
 
87 aa  124  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  76.39 
 
 
89 aa  122  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  65.93 
 
 
90 aa  121  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  70.83 
 
 
88 aa  117  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  70.83 
 
 
88 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  71.43 
 
 
90 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  62.03 
 
 
99 aa  100  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  60.44 
 
 
93 aa  100  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  69.57 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  64.79 
 
 
86 aa  97.1  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  61.11 
 
 
96 aa  95.1  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  69.7 
 
 
93 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  59.74 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  66.67 
 
 
92 aa  94  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  63.01 
 
 
97 aa  90.1  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  65.15 
 
 
97 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  55.41 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  55.71 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  59.42 
 
 
93 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  61.19 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  55.22 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  47.73 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  60.94 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  54.55 
 
 
74 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  54.41 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  54.69 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  51.56 
 
 
332 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  56.67 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 
366 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  42.65 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  52.63 
 
 
68 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  52.46 
 
 
293 aa  58.9  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  42.62 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0445  conserved hypothetical protein  45.31 
 
 
78 aa  57  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1331  ATP-NAD/AcoX kinase  52.94 
 
 
326 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.441471  normal  0.309814 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  47.54 
 
 
293 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0973  hypothetical protein  44.78 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  40.91 
 
 
326 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  42.62 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>