37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2048 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  140  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  61.4 
 
 		 74 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  62.07 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  55.71 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  56.14 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  54.39 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  54.39 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  52.73 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  55.56 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  52.73 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  50.91 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  42.62 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  45 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  51.92 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  51.85 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  51.92 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  49.09 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  49.09 
 
 		 89 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  47.46 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  45.1 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  45.76 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  42.86 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  55.81 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1623  hypothetical protein  40.98 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0247815 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  46.3 
 
 		 332 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  44.44 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 366 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0973  hypothetical protein  42.11 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>