42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0497 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  167  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  78.57 
 
 
76 aa  107  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1623  hypothetical protein  56.58 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0247815 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  68.25 
 
 
77 aa  80.9  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  46.03 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  42.31 
 
 
78 aa  67  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1535  hypothetical protein  62.9 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.397165  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  49.18 
 
 
74 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  41.89 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  41.67 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  43.55 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  41.79 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  46.03 
 
 
332 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  39.34 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  40.98 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  42.62 
 
 
92 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  44.26 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  38.33 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.68 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  42.62 
 
 
68 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  40.32 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  39.34 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  37.7 
 
 
92 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  39.34 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  39.34 
 
 
89 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  39.34 
 
 
93 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  35.48 
 
 
88 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  39.68 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
88 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  40.3 
 
 
326 aa  50.1  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  34.43 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
366 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
293 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  35.82 
 
 
293 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0445  conserved hypothetical protein  38.1 
 
 
78 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>