36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1535 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1535  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  159  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.397165  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1623  hypothetical protein  62.34 
 
 
131 aa  103  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0247815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  60.94 
 
 
81 aa  84  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  57.35 
 
 
76 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  49.21 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  45.31 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  44.62 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  43.55 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 
96 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  39.34 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  39.13 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  37.31 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  39.13 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
93 aa  48.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  34.33 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  34.33 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  37.7 
 
 
92 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  40.32 
 
 
332 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  40.32 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  40.98 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  35.38 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  32.31 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  36.07 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  36.62 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  30.77 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
293 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  40.32 
 
 
326 aa  42.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  34.43 
 
 
93 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  34.43 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>