42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0369 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
88 aa  174  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  71.76 
 
 
92 aa  124  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  63.64 
 
 
88 aa  116  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  63.64 
 
 
88 aa  116  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  63.64 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
87 aa  114  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  64.04 
 
 
90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  63.29 
 
 
96 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  64.79 
 
 
99 aa  96.7  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  66.22 
 
 
93 aa  96.3  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  62.5 
 
 
103 aa  94  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 
86 aa  92  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  65.22 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  65.28 
 
 
93 aa  91.3  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  64.29 
 
 
90 aa  90.1  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  57.53 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  58.57 
 
 
94 aa  88.6  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  64.18 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  63.77 
 
 
92 aa  88.6  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  55.41 
 
 
93 aa  87.4  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  56.94 
 
 
97 aa  87.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  56.94 
 
 
97 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  56.72 
 
 
105 aa  84.3  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  59.09 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  48.24 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  53.85 
 
 
74 aa  77  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  46.84 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  50.62 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  51.56 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  53.12 
 
 
78 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
366 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
105 aa  60.1  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  42.86 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1331  ATP-NAD/AcoX kinase  59.09 
 
 
326 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.441471  normal  0.309814 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  40.98 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
293 aa  55.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  42.65 
 
 
293 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0973  hypothetical protein  43.28 
 
 
85 aa  54.7  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  41.54 
 
 
326 aa  53.9  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  49.09 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0445  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 
78 aa  52  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  43.55 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>