36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0973 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0973  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  171  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.346904 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0445  conserved hypothetical protein  53.62 
 
 
78 aa  68.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  43.48 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  45.07 
 
 
92 aa  57  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  44.78 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  44.78 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  44.78 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 
88 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  44.12 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 
366 aa  53.9  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  42.42 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  43.28 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  42.19 
 
 
74 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  42.03 
 
 
93 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  43.28 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  45.59 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
87 aa  50.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
90 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  43.94 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.82 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  41.18 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  41.18 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  42.65 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  53.49 
 
 
326 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  42.42 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  38.81 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  34.85 
 
 
332 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1331  ATP-NAD/AcoX kinase  52.27 
 
 
326 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.441471  normal  0.309814 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  39.71 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  42.11 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
293 aa  40  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0527045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>