44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3307 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  59.74 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  54.02 
 
 		 99 aa  93.6  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  57.69 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  62.5 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  61.11 
 
 		 89 aa  92.8  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  55.13 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.67 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  56.34 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  55.22 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  55.22 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  51.47 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  61.19 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  58.06 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  47.62 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  45.95 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  44.58 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  50.79 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  44.3 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  48.61 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  51.61 
 
 		 332 aa  67  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  44.74 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  48.39 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  48.44 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 366 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  33.82 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  38.33 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  40 
 
 		 293 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0445  conserved hypothetical protein  43.55 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  45 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1331  ATP-NAD/AcoX kinase  52.94 
 
 		 326 aa  53.5  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.441471  normal  0.309814 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0973  hypothetical protein  43.94 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  37.33 
 
 		 326 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  39.68 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1535  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.397165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>