42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0549 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  76.92 
 
 		 93 aa  131  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  76.92 
 
 		 93 aa  130  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  74.16 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  77.92 
 
 		 92 aa  123  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  71.43 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  67.14 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  59.77 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 87 aa  94  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  62.86 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  62.86 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  64.29 
 
 		 88 aa  90.1  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  57.89 
 
 		 99 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.63 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  55.22 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  54.67 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  57.35 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  47.62 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  52.17 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  48.48 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  52.94 
 
 		 86 aa  66.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  48.53 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  57.58 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  44.93 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  38.71 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0445  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  39.34 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  51.92 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  50.82 
 
 		 293 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1331  ATP-NAD/AcoX kinase  37.35 
 
 		 326 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.441471  normal  0.309814 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 293 aa  50.8  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  34.92 
 
 		 326 aa  45.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0973  hypothetical protein  39.71 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  40.32 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>