42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0184 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 87 aa  169  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  76.25 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  66.67 
 
 		 89 aa  123  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  68.18 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  59.77 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  59.77 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  63.22 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  64.94 
 
 		 99 aa  97.1  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  56.67 
 
 		 90 aa  94  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  64.71 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  58.33 
 
 		 93 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  58.62 
 
 		 93 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  61.19 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  61.64 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  58.9 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  61.19 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  59.42 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  60.61 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  60.61 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  55.88 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  54.55 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  55.56 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  54.69 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  46.51 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  53.12 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  54.69 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  50 
 
 		 332 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  42.62 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 366 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  40.32 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  52.73 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1331  ATP-NAD/AcoX kinase  50.94 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.441471  normal  0.309814 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  45.16 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  45.16 
 
 		 293 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  42.42 
 
 		 326 aa  53.5  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0445  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 		 78 aa  52.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0973  hypothetical protein  41.79 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.346904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>