41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3279 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  63.22 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  64.79 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  53.41 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  54.02 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 88 aa  92  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  54.67 
 
 		 88 aa  89.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  56 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  52.44 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  62.12 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  53.75 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  55.41 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  55.22 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.43 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  48.48 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  48.48 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  48.48 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  48.44 
 
 		 332 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  49.23 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  46.88 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  47.06 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  42.42 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 366 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  36.84 
 
 		 293 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  34.43 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  39.39 
 
 		 326 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0445  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  30.65 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  38.6 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  37.7 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1331  ATP-NAD/AcoX kinase  36.07 
 
 		 326 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.441471  normal  0.309814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>