42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4868 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  181  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  95.45 
 
 
88 aa  173  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  78.41 
 
 
89 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  79.78 
 
 
90 aa  147  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  63.64 
 
 
88 aa  116  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  70.83 
 
 
92 aa  115  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  59.77 
 
 
87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  61.97 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  62.86 
 
 
90 aa  92  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  66.18 
 
 
93 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  66.67 
 
 
93 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  59.42 
 
 
97 aa  90.1  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  57.97 
 
 
97 aa  88.6  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  56 
 
 
86 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  55.13 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  55.84 
 
 
92 aa  88.6  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  58.11 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  49.33 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  60.29 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  58.82 
 
 
93 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  57.58 
 
 
105 aa  83.6  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  59.09 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  55.71 
 
 
94 aa  80.1  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  54.41 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  56.06 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  52.31 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  51.56 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  48.53 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  47.69 
 
 
74 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  44.12 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 
366 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  41.27 
 
 
76 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1331  ATP-NAD/AcoX kinase  52.94 
 
 
326 aa  57  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.441471  normal  0.309814 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  52.73 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0973  hypothetical protein  44.78 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.346904 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0445  conserved hypothetical protein  42.62 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
293 aa  53.5  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  35.48 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  36.92 
 
 
326 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
105 aa  51.2  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  42.62 
 
 
293 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  38.81 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>