127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3072 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3072  non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 
1044 aa  2101    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273972  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1002  non-ribosomal peptide synthetase  26.37 
 
 
1358 aa  231  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0203382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1102  non-ribosomal peptide synthetase  26.41 
 
 
1345 aa  221  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0166801  normal  0.534477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2107  nonribosomal peptide synthetase, putative  24.8 
 
 
1456 aa  212  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.960336  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  25.48 
 
 
1332 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4662  amino acid adenylation  25.31 
 
 
1346 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5328  amino acid adenylation domain-containing protein  25.93 
 
 
1351 aa  194  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4452  non-ribosomal peptide synthetase  25.89 
 
 
1395 aa  179  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270452  normal  0.260871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5851  amino acid adenylation domain protein  24.17 
 
 
1343 aa  177  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3770  non-ribosomal peptide synthetase  25.57 
 
 
1302 aa  173  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5529  non-ribosomal peptide synthetase  24.85 
 
 
1356 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0099449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  25.82 
 
 
1360 aa  166  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  26.18 
 
 
1368 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5386  non-ribosomal peptide synthetase  26.09 
 
 
1318 aa  160  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6239  hypothetical protein  26.19 
 
 
1307 aa  159  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380484  normal  0.45462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1404  non-ribosomal peptide synthetase  25.99 
 
 
1324 aa  156  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305242  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20090  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  23.9 
 
 
1344 aa  155  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0150684  normal  0.025182 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14440  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  25.39 
 
 
1297 aa  151  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1493  non-ribosomal peptide synthetase  26.36 
 
 
1337 aa  150  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4411  non-ribosomal peptide synthetase  24.36 
 
 
1293 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.705527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4602  non-ribosomal peptide synthetase  25.17 
 
 
1337 aa  149  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381211  hitchhiker  0.000116463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5172  non-ribosomal peptide synthetase  25.47 
 
 
1311 aa  144  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.066843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21070  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  24.63 
 
 
1309 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.642428  normal  0.678739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1495  non-ribosomal peptide synthetase  24.59 
 
 
1316 aa  141  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4786  non-ribosomal peptide synthetase-like protein  25.36 
 
 
1311 aa  134  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0680721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4872  non-ribosomal peptide synthetase  25.36 
 
 
1311 aa  134  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.169627  normal  0.377916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15080  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  25.47 
 
 
1291 aa  132  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.628151  normal  0.903527 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48666  predicted protein  23.48 
 
 
1643 aa  112  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0961271  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43214  predicted protein  25.94 
 
 
1657 aa  108  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3071  amino acid adenylation domain protein  32.02 
 
 
3291 aa  66.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48436  predicted protein  23.69 
 
 
1503 aa  61.6  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  40 
 
 
1864 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  32.03 
 
 
3395 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1989  putative glycan acetyltransferase  27.52 
 
 
226 aa  54.7  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000266914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  41.03 
 
 
1769 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  33.91 
 
 
2138 aa  52.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  39.29 
 
 
7785 aa  52  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3719  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
191 aa  51.6  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0108777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  32.48 
 
 
1167 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0191  amino acid adenylation domain-containing protein  44.33 
 
 
1071 aa  50.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604981  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  31.78 
 
 
4290 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  35.83 
 
 
1356 aa  49.7  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1683  hexapaptide repeat-containing transferase  29.46 
 
 
166 aa  49.7  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518627  normal  0.557053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  39.42 
 
 
3227 aa  49.7  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  27.1 
 
 
2410 aa  48.9  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.61 
 
 
1876 aa  48.5  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  30.38 
 
 
7168 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  35.79 
 
 
11233 aa  48.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  30.77 
 
 
1167 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  30.77 
 
 
1167 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2140  peptide synthetase-domain-containing protein  40.45 
 
 
633 aa  48.1  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2525  amino acid adenylation domain-containing protein  40.45 
 
 
633 aa  48.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  39.44 
 
 
3942 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  38.89 
 
 
3710 aa  48.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1638  peptide synthetase-domain-containing protein  40.45 
 
 
612 aa  48.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3173  peptide synthetase-domain-containing protein  40.45 
 
 
612 aa  48.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1415  peptide synthetase-domain-containing protein  40.45 
 
 
612 aa  48.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  37.89 
 
 
3404 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0847  condensation domain-containing protein  35.71 
 
 
940 aa  47.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.369359  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  49.23 
 
 
6113 aa  47.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  42.68 
 
 
2878 aa  47.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  29.13 
 
 
175 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4853  hexapeptide repeat-containing transferase  26.88 
 
 
170 aa  47  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.75 
 
 
2666 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0299  acetyltransferase-like protein  29.33 
 
 
185 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0238775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  35.87 
 
 
7310 aa  46.6  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  45.83 
 
 
5230 aa  47  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  33.75 
 
 
1317 aa  47  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  36.96 
 
 
5596 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  37.37 
 
 
5213 aa  46.6  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  32.65 
 
 
6676 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  40 
 
 
1829 aa  46.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  34.44 
 
 
2258 aa  46.2  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1236  nonribosomal peptide synthetase, putative  36 
 
 
1144 aa  46.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  34.48 
 
 
4489 aa  46.2  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  31.91 
 
 
2189 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  31.76 
 
 
2448 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  39.33 
 
 
612 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0745582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  37.14 
 
 
4991 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1657  hypothetical protein  32.61 
 
 
145 aa  46.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  32.65 
 
 
210 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  34.12 
 
 
5738 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.36 
 
 
4531 aa  45.8  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  25.9 
 
 
174 aa  45.8  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  29.17 
 
 
2560 aa  45.8  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0939  maltose O-acetyltransferase  34.62 
 
 
183 aa  45.8  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  38.55 
 
 
1497 aa  45.8  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5009  transferase hexapeptide domain-containing protein  26.88 
 
 
170 aa  45.8  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4838  hexapeptide repeat-containing transferase  26.88 
 
 
170 aa  45.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2667  peptide synthetase-domain-containing protein  39.33 
 
 
630 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5389  transferase hexapeptide domain-containing protein  26.88 
 
 
170 aa  45.8  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  38.46 
 
 
4165 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  31.53 
 
 
179 aa  45.8  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2137  linear gramicidin synthetase subunit C  35.71 
 
 
1719 aa  45.8  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3177  nonribosomal peptide synthetase  35.71 
 
 
1719 aa  45.8  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1411  linear gramicidin synthetase subunit C  35.71 
 
 
1719 aa  45.8  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.750656  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  37.04 
 
 
1914 aa  45.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  29.9 
 
 
3086 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5245  transferase hexapeptide domain protein  26.88 
 
 
170 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12405  peptide synthetase mbtE  34.29 
 
 
1731 aa  45.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.517103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>