More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1489 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1489  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
378 aa  748    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.258643  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1926  aminodeoxychorismate synthase component I  55.5 
 
 
412 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4651  aminodeoxychorismate synthase component I  55.82 
 
 
424 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4272  aminodeoxychorismate synthase component I  55.29 
 
 
424 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4358  aminodeoxychorismate synthase component I  55.29 
 
 
424 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11024  aminodeoxychorismate synthase component I  53.9 
 
 
458 aa  359  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000154796  normal  0.736978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4807  aminodeoxychorismate synthase component I  54.8 
 
 
420 aa  359  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3238  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.55 
 
 
371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32510  aminodeoxychorismate synthase component I  45.82 
 
 
438 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1171  Chorismate binding-like protein  49.22 
 
 
732 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416278  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.38 
 
 
470 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  43.51 
 
 
468 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.32 
 
 
509 aa  196  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.05 
 
 
470 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.81 
 
 
472 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.81 
 
 
466 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  42.28 
 
 
467 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.01 
 
 
472 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.48 
 
 
467 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.11 
 
 
467 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.75 
 
 
467 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.93 
 
 
470 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.29 
 
 
458 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  40.29 
 
 
458 aa  189  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.64 
 
 
456 aa  189  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  40.29 
 
 
458 aa  189  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.56 
 
 
452 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.84 
 
 
460 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  36.53 
 
 
453 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.75 
 
 
474 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.73 
 
 
457 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.55 
 
 
466 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.24 
 
 
476 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.17 
 
 
480 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  36.22 
 
 
453 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  36.22 
 
 
453 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  36.22 
 
 
453 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  39.78 
 
 
471 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.9 
 
 
473 aa  186  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.22 
 
 
453 aa  186  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.22 
 
 
453 aa  186  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.01 
 
 
464 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.55 
 
 
470 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.21 
 
 
449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  36.22 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  36.83 
 
 
445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0453  para-aminobenzoate synthase, component I  38.24 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0249447  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  39.69 
 
 
458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.72 
 
 
457 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.76 
 
 
471 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.44 
 
 
592 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  35.91 
 
 
453 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.86 
 
 
480 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  44.86 
 
 
462 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  37.77 
 
 
509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  38.95 
 
 
731 aa  183  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.35 
 
 
618 aa  182  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  37.73 
 
 
456 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1137  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.5 
 
 
476 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.174  normal  0.645122 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  40.98 
 
 
607 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.38 
 
 
480 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.39 
 
 
469 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.53 
 
 
555 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.1 
 
 
721 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  40.65 
 
 
454 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.53 
 
 
490 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1766  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.47 
 
 
718 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  40.65 
 
 
454 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  40.65 
 
 
454 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.94 
 
 
607 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.73 
 
 
457 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  40.65 
 
 
454 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  40.47 
 
 
398 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  40.65 
 
 
454 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.32 
 
 
455 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.19 
 
 
577 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.44 
 
 
611 aa  177  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.87 
 
 
601 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3468  anthranilate synthase, component II  39.08 
 
 
714 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  36.06 
 
 
453 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.9 
 
 
469 aa  176  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  38.29 
 
 
476 aa  176  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.53 
 
 
467 aa  176  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  42.07 
 
 
587 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.26 
 
 
466 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  39.42 
 
 
495 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.82 
 
 
477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  37.17 
 
 
456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  41.34 
 
 
586 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.91 
 
 
617 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.46 
 
 
450 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3761  para-aminobenzoate synthase  42.8 
 
 
703 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331515  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.89 
 
 
461 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.02 
 
 
553 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  38.02 
 
 
491 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.62 
 
 
466 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.63 
 
 
629 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  37.84 
 
 
430 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.32 
 
 
584 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  37.84 
 
 
430 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>