More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32510 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_32510  aminodeoxychorismate synthase component I  100 
 
 
438 aa  860    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11024  aminodeoxychorismate synthase component I  52.93 
 
 
458 aa  363  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000154796  normal  0.736978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1926  aminodeoxychorismate synthase component I  52.62 
 
 
412 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4807  aminodeoxychorismate synthase component I  53.85 
 
 
420 aa  351  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4651  aminodeoxychorismate synthase component I  51.82 
 
 
424 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4358  aminodeoxychorismate synthase component I  52.35 
 
 
424 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4272  aminodeoxychorismate synthase component I  52.35 
 
 
424 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424437  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1489  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.82 
 
 
378 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.258643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1171  Chorismate binding-like protein  48.04 
 
 
732 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416278  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3238  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.78 
 
 
371 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  41.06 
 
 
462 aa  216  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.06 
 
 
480 aa  216  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.22 
 
 
466 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  37.85 
 
 
471 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.58 
 
 
471 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.76 
 
 
618 aa  207  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  46.24 
 
 
468 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.06 
 
 
466 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  37.94 
 
 
491 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.4 
 
 
741 aa  200  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.68 
 
 
460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.71 
 
 
449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.09 
 
 
601 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.7 
 
 
447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  35.32 
 
 
453 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.76 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.32 
 
 
452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  35.32 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  35.32 
 
 
453 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  35.32 
 
 
453 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  35.32 
 
 
453 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  38.12 
 
 
495 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.64 
 
 
467 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.83 
 
 
467 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  37.29 
 
 
447 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  37.69 
 
 
443 aa  196  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  43.02 
 
 
491 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  35.37 
 
 
497 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  35.29 
 
 
430 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.06 
 
 
453 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  36.36 
 
 
453 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.06 
 
 
453 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.66 
 
 
450 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.46 
 
 
466 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3258  anthranilate synthase component I-like protein  34.92 
 
 
511 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  35.58 
 
 
456 aa  194  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  34.68 
 
 
430 aa  193  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.49 
 
 
490 aa  193  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.79 
 
 
467 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  40.77 
 
 
465 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  39.04 
 
 
408 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.11 
 
 
480 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.16 
 
 
469 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.36 
 
 
721 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0615  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.41 
 
 
434 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0184347  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.35 
 
 
474 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.36 
 
 
467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.11 
 
 
469 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  37.26 
 
 
454 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2217  Anthranilate synthase  31.2 
 
 
439 aa  190  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  36.99 
 
 
454 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2866  anthranilate synthase component I-like protein  36.81 
 
 
469 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  35.28 
 
 
491 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  37.05 
 
 
454 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  35.71 
 
 
491 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  35.47 
 
 
445 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  46.15 
 
 
555 aa  189  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  42.26 
 
 
491 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  44.88 
 
 
586 aa  189  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  43.85 
 
 
487 aa  189  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  36.71 
 
 
454 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5240  para-aminobenzoate synthase, component I  34.99 
 
 
465 aa  189  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  36.49 
 
 
454 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.77 
 
 
458 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  38.5 
 
 
453 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2036  Anthranilate synthase  44.4 
 
 
478 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0992508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  34.52 
 
 
465 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  40.77 
 
 
458 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  40.77 
 
 
458 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.54 
 
 
607 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0068  para-aminobenzoate synthase component I  39.7 
 
 
465 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0064  para-aminobenzoate synthase component I  39.7 
 
 
465 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0064  para-aminobenzoate synthase component I  39.7 
 
 
465 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  37.29 
 
 
447 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  39.7 
 
 
465 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  34.16 
 
 
465 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  47.33 
 
 
587 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0077  para-aminobenzoate synthase, component I  39.7 
 
 
465 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000409192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0076  para-aminobenzoate synthase, component I  40.38 
 
 
465 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  34.43 
 
 
480 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.16 
 
 
476 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.58 
 
 
456 aa  186  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3230  anthranilate synthase component I-like protein  35.54 
 
 
469 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.359242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  35.28 
 
 
467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.73 
 
 
466 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.58 
 
 
611 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.24 
 
 
710 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.98 
 
 
470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.12 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.98 
 
 
470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>