57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3475 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3475  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 
142 aa  298  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3366  cell wall hydrolase SleB  90.85 
 
 
143 aa  273  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.015615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3911  cell wall hydrolase SleB  71.13 
 
 
140 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5519  cell wall hydrolase  69.72 
 
 
140 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5513  cell wall hydrolase  69.72 
 
 
140 aa  208  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5088  cell wall hydrolase; cortex lytic enzyme  69.72 
 
 
140 aa  208  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000764028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5569  cell wall hydrolase  69.01 
 
 
140 aa  207  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5071  cell wall hydrolase; cortex lytic enzyme  69.01 
 
 
140 aa  204  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0510277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5485  cell wall hydrolase  69.01 
 
 
140 aa  204  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5241  cell wall hydrolase  69.01 
 
 
140 aa  204  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5640  cell wall hydrolase  69.01 
 
 
140 aa  204  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5183  cell wall hydrolase SleB  69.01 
 
 
140 aa  204  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5438  cell wall hydrolase  68.31 
 
 
140 aa  203  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2652  cell wall hydrolase  60.14 
 
 
142 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0022634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2341  cell wall hydrolase  58.74 
 
 
142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5373  cell wall hydrolase SleB  57.75 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2417  cell wall hydrolase  58.74 
 
 
142 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0159574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2376  cell wall hydrolase  58.74 
 
 
142 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2612  cell wall hydrolase  58.74 
 
 
142 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000069334 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2594  cell wall hydrolase  58.74 
 
 
142 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2542  cell wall hydrolase SleB  58.74 
 
 
142 aa  169  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0951655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2614  cell wall hydrolase  59.44 
 
 
142 aa  169  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0113298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2568  cell wall hydrolase  58.04 
 
 
142 aa  168  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2756  cell wall hydrolase  58.04 
 
 
142 aa  168  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000284234 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0007  cell wall hydrolase CwlJ  72.09 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  0.516819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  32.52 
 
 
197 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  33.6 
 
 
236 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1357  cell wall hydrolase, SleB  31.16 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.527698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  32 
 
 
546 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  30.47 
 
 
239 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  31 
 
 
234 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  31.63 
 
 
242 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  29 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  25.71 
 
 
185 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  31.37 
 
 
277 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  32.35 
 
 
208 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  30.56 
 
 
239 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  32.69 
 
 
286 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  31.43 
 
 
239 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  27.73 
 
 
241 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2350  cell wall hydrolase, SleB  28.47 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000225422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  31.48 
 
 
235 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  35.64 
 
 
225 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  30.48 
 
 
310 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  27.45 
 
 
242 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  31.73 
 
 
261 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  30.4 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  29.1 
 
 
262 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  29.6 
 
 
163 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  27.88 
 
 
234 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  30.69 
 
 
253 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  24.8 
 
 
270 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  32.2 
 
 
197 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  26 
 
 
267 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  26.17 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  25.95 
 
 
400 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  29.69 
 
 
203 aa  40  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>