113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1805 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1805  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  646    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
393 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  25.08 
 
 
404 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  26.07 
 
 
390 aa  62.8  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  26.07 
 
 
390 aa  62.8  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  24.21 
 
 
413 aa  62.8  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  25.08 
 
 
404 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  24.1 
 
 
404 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  25.87 
 
 
422 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  25.17 
 
 
404 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  25.17 
 
 
404 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.78 
 
 
412 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  20 
 
 
420 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  21.41 
 
 
444 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  23.58 
 
 
412 aa  56.2  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  22.54 
 
 
413 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
482 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2647  macrolide efflux protein  23.43 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376776  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  22.97 
 
 
404 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
482 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2935  transporter, putative  23.61 
 
 
400 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00291638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2702  major facilitator transporter  22.85 
 
 
400 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00155167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2624  macrolide efflux protein  23.1 
 
 
400 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  20.58 
 
 
432 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2698  transporter  23.1 
 
 
400 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2896  transporter  23.1 
 
 
400 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  31.87 
 
 
424 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2945  putative transporter  23.43 
 
 
400 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000764756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2897  putative transporter  23.1 
 
 
400 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000603201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  21.3 
 
 
408 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  22.03 
 
 
532 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 
433 aa  53.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.64 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0877  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  25.36 
 
 
422 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  21.13 
 
 
426 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
421 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  25.76 
 
 
417 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2912  putative transporter  22.61 
 
 
400 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  22.02 
 
 
446 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2334  putative transporter  22.61 
 
 
400 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.609115  hitchhiker  0.000374493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.04 
 
 
422 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  21.86 
 
 
478 aa  49.3  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  24.74 
 
 
414 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  24.91 
 
 
438 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  25.82 
 
 
410 aa  48.9  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.59 
 
 
418 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 
407 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.97 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  23.65 
 
 
413 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  24.39 
 
 
422 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  24.04 
 
 
412 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  18.85 
 
 
406 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  24.2 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  24.2 
 
 
417 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2448  major facilitator transporter  23.01 
 
 
403 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00172355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  22.75 
 
 
442 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
418 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3650  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 
426 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  22.9 
 
 
408 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  22.9 
 
 
408 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  22.56 
 
 
471 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  22.19 
 
 
418 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  22.34 
 
 
413 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 
417 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  22.06 
 
 
415 aa  47  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  22.9 
 
 
408 aa  47  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 
401 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  23.08 
 
 
410 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.58 
 
 
408 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  18.85 
 
 
406 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  24.2 
 
 
414 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  23.69 
 
 
422 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.86 
 
 
422 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  22.78 
 
 
530 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  23.86 
 
 
422 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  22.34 
 
 
362 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  21.76 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
397 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
405 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  24.21 
 
 
417 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  27.73 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  23.84 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  24.21 
 
 
415 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  27.73 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  20.08 
 
 
445 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.83 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 
422 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.83 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  24.26 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  23.13 
 
 
415 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  19.24 
 
 
393 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  27.13 
 
 
413 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5404  major facilitator transporter  24.6 
 
 
418 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  23.86 
 
 
422 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  23.86 
 
 
422 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  23.86 
 
 
422 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
410 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>